乾隆二十二年（1757年）三月，霍集占（小和卓）趁阿睦尔撒纳在北疆掀起叛乱（阿睦尔撒纳之乱），清军主力无法南顾之际，率部突袭了驻防在南疆重镇库车的清军，清军库车守将阿敏道以下全部殉国，随后霍集占宣布公开与大清帝国决裂，加上北疆的阿睦尔撒纳之乱，大清帝国好不容易开拓的新疆全部失控。

当天山南北叛乱的消息传到京师，乾隆火速诏命清军清军悍将成衮扎布、兆惠全力平叛，并制定先平阿睦尔撒纳，再进兵南疆的战略计划。在清军摧枯拉朽的攻势下，阿睦尔撒纳兵败逃亡沙俄，清军底定北疆。乾隆二十三年正月二十六日癸丑（1758年3月5日），清廷情报机构粘杆处的探子在圣彼得堡侦知阿睦尔撒纳因染天花暴死，乾隆悬着的心终于放下了。随即，乾隆下诏征讨霍集占。

凭借着在攻灭准噶尔汗国特别是在平定达瓦齐之乱、阿睦尔撒纳之乱的威望，清军在天山以南的各部中如天神般地位，是故，清军南下后，沿途纷纷开门投降，阿克苏、乌什等南疆重镇皆兵不血刃归附清军。出奇的顺利导致清军主将兆惠犯了骄傲轻敌的错误，为了尽快平定叛乱，兆惠亲自率军3000人长驱直入进攻叛军老巢叶尔羌，结果被霍集占和波罗尼都（大和卓）围困在黑水营100多天，险些全军覆没，是为黑水营之围。

为了营救黑水营中的清军，乾隆以富德为定边右副将军，节制副都统阿里衮、舒赫德、爱隆阿等清军悍将；并诏令陕甘总督黄廷桂准备20000匹战马，随时准备支援新疆的清军；还命令成衮扎布在北疆诸地招抚原准噶尔汗国的军人，扩充新疆的清军总体实力，同时大量准备物资粮草，要知道在新疆打仗，清军最怕的就是粮草，因为这里不像内地，无法就近筹措军粮，清军吃的每一粒粮食都得从关内输送，而一旦断粮，就得几个月才能接济得上，这也是清军与准噶尔汗国缠斗70年以及后来南疆经常性叛乱的根本原因，清军每次都能赢，但无法久持，后勤是根本原因。言归正传，乾隆二十三年十一月十一日，富德率援救军团3500人从乌鲁木齐出发，日夜兼程开赴阿克苏。领队大臣豆斌、散秩大臣永庆、副都统瑚尔起、福禄、总管端济布等各率千余人分进合击，目的地黑水营。

十二月十六日，富德抵达清军在南疆最大的补给站阿克苏，在此补充给养后，富德继续南下。当月二十五日，阿里衮也到达阿克苏。乾隆二十四年正月初六日（1759年2月3日），富德率军抵达叶尔羌东北的呼尔满，从望远镜中富德已经可以看见黑水营上空飘扬的大清龙旗。也正在此时，5000余名叛军精锐前来阻击清军，防止其与黑水营中的清军会合，富德遂率军与叛军在呼尔满展开激战。因为清军劳师远征，叛军以逸待劳，再加上叛军在人数上占优势，是故，战斗进入了对峙状态，富德一时无法歼灭这股叛军，只得暂时停战休息。正月初九日（2月6日）夜，阿里衮率援军1000余人抵达呼尔满战场，当即就从两翼突袭叛军，富德见状也乘势进攻叛军正面防线，叛军在清军三面攻势下，迅速崩溃，清军大破叛军，斩首叛军千余级，是为呼尔满之战，也叫呼尔满大捷。

呼尔满之战后，叛军士气大跌，不久后黑水营之围遂解，富德与兆惠合兵一处，开始了对叛军的反攻。大小和卓只得向西逃窜，最终在巴达克山伏诛。