吴茱萸治水气上冲，有治呕镇痛的作用。凡是胃停水，胃虚者多，故用人参、大枣，补胃之虚。所以吴茱萸汤一方面治标，用吴茱萸、生姜治其水气上冲之呕;另一方面患者胃虚，胃虚则水停，所以用人参、大枣从根本上恢复胃的功能。
“干呕，吐涎沫，头痛者，吴茱萸汤主之”。水气往上冲，“吐涎沫”、“头痛”、“头晕”均可见，尤其是在临床上以头晕最为多见。
很多的头晕都是吴茱萸汤证，但必须要见到恶心，即“呕”。吐也可、不吐亦可，但都要有恶心的症状，一动就要吐。
胃停水而出现的头晕、头眩、头冒，都是水气冲击大脑所致。吴茱萸汤证的水往上冲最厉害了，所以临床上的美尼尔氏证很多都是吴茱萸汤证。
吴茱萸汤不但治胃有停水，也治胃痛。但吴茱萸是个大温性药，利于虚寒，不利于实热。如果在临床上考虑这个人有热，尤其是实热，吴茱萸要小心使用了。虚寒的无论是头痛、头晕、吐涎沫，以至于胃疼，但凡有呕，都好用。
