唐代至元代的古Uyghur语与近现代的新Uyghur语基本同属突厥语，在文法上并没有大的变化。可是两者不仅文字完全不一样，词汇的变化也相当大。换言之，在伊斯兰化以后，阿拉伯——波斯系统的文字及词汇大量流入Uyghur语，到清朝以后Uyghur语又从汉语借用了大量的词汇。