普伐他汀是水溶性他汀，匹伐他汀是脂溶性他汀

对肝功能影响、肌肉损伤以及对血糖的影响等方面，匹伐他汀更少一些。但脂溶性高的药物更容易穿透人体的生物屏障，所以匹伐他汀吸收更快，也更容易进入大脑，较容易出现胃部不适、头晕等一般性不良反应。

脂溶性高的药物更容易与血浆蛋白结合，在多种药物联用时，容易把其他与血浆蛋白结合的药物置换出来。普伐他汀的蛋白结合率只有53.1%，而匹伐他汀的蛋白结合率在95%以上，两者相比，在与其他药物联用时普伐他汀的安全性更高。