广州商团原是1912年成立的广州商人自卫组织，1919年由英国汇丰银行广州支行买办陈廉伯和佛山大地主陈恭受担任正副团长后，在英国的操纵和支持下，势力迅速扩大，发展成为拥有数千人的武装。在英国的怂恿下，他们大肆购买军火，企图和军阀陈炯明里应外合，推翻广东革命政府，建立所谓“商人政府”。 1924年8月，商团向香港南利洋行订购了大量枪支弹药，由悬挂丹麦国旗的轮船“哈佛号”偷运至广州。孙中山得此消息后，立即下令黄埔军校师生扣留枪械，并下令通缉商团头目陈廉伯、陈恭受。陈廉伯逃往香港，指使商团罢市“抗争”。8月下旬，全省罢市商埠已达一百多处。10月10日，广州各界在庆祝双十节游行时，商团竟然向游行队伍开枪射击，当场打死打伤群众和工团军数十人，被称为“双十惨案”。接着，商团封锁了市区，并贴出“请孙文下野”、“请陈炯明回省主政”等标语，准备与陈炯明配合，夺取广州政权。与此同时，英国也出动炮舰为商团助威，盘踞东江的陈炯明也准备向广州发动进攻。广州陷于恐怖和混乱之中，革命情势岌岌可危。 在这危急时刻，正在韶关准备北伐的孙中山在共产党人和国民党左派的支持下，否定了国民党内部的妥协主张，断然决定武力平息商团叛乱，在大本营成立了镇压商团叛乱的指挥机构——革命委员会。10月13日，孙中山由韶关回师广州，命令参加北伐的全部警卫军和湘、粤军各一部，星夜兼程回师广州平叛。10月14日，孙中山下令解散广州商团。15日晨，政府军和黄埔学生军在工农武装和群众协助下，分五路向商团军发起总攻，激战数小时，将商团军全部歼灭。商团叛乱的平定，使广东革命政权得到初步稳定。