关于清朝帝后陵的东配殿的功用，差不多谁都知道在大祭的前一天将祝版和制帛放在东配殿。第二天祭祀前把祝版和制帛取出，陈列到隆恩殿。可是经过后来不断的研究，发现东配殿还有其他的功用。

比如慕东陵的东配殿和西配殿都曾停放过妃嫔的棺椁。有的棺椁在慕东陵配殿漆饰。

供入太庙和陵寝的皇帝神牌和部分皇后的神牌都在东配殿做造。

另外，嘉庆皇帝祭祀裕陵时，曾到裕陵东配殿更换衣服。