1904年2月23日，日俄战争刚刚开启，日本不容许朝鲜半岛中立，于是迅速强迫李氏朝鲜签订《日韩议定书》，明确“大日本帝国政府确实保证大韩帝国之独立及领土完整”（第二条），同时日本拥有在朝鲜半岛“临机使用军事战略上之必要地点”的权力。由于这一时期的日俄战争尚处于起始阶段，日本没有太多政治资源考虑李氏朝鲜的政权组建问题，于是便先行夺取其军事据点以为己用。

随着战事进展逐步顺利，日本也开始对朝鲜半岛施加政治影响。5月18日，元老伊藤博文来到汉城，敦促李氏朝鲜废除与俄罗斯签订的一切条约；8月22日，日本政府强迫李氏朝鲜签订第一次《日韩协约》，规定李氏朝鲜政府必须雇用由日本推荐的人选担任财务与外交顾问，任何外交事宜必须与日本协商。取消外交自主权是吞并朝鲜半岛的重要步骤，随后朝鲜外交机构逐渐从汉城转移到东京。

很明显，日本在战争进行过程中就已经把朝鲜半岛视为囊中之物。1905年1月25日，日本驻美公使高平小五郎也特地向老罗斯福提出：“朝鲜半岛已自然成为日本帝国之国防外围，因而我帝国政府认为，在该国完全维持帝国之优越势力，对于帝国之康宁静谧不可或缺。”这番要求得到老罗斯福的默许，也就有了后来7月桂太郎与美国国防部长塔夫托签署的备忘录。老罗斯福甚至表示“即使日本单方面宣布在韩国设立保护权，也予以支持”。

日俄《朴茨茅斯和约》签署后，日本对于朝鲜半岛的“优越权”得到盟友英国、斡旋方美国、敌对方俄罗斯三方的共同认可。11月17日，日本驻朝鲜公使林权助逼迫李氏朝鲜政府签订第二次《日韩协约》，这一次的协约比起上一次要更加严苛，不仅剥夺李氏朝鲜独立的外交权，还要“设置一名统监作为代表，驻在汉城，并有谒见韩国皇帝陛下之权”。随后的12月，元老伊藤博文被任命为初代“朝鲜统监”，这也成为日本吞并朝鲜半岛的过渡形态。1906年3月，伊藤博文来到汉城赴任。

由于朝鲜半岛抵抗日本的运动越来越频繁，伊藤博文首先开始扶持亲日朝鲜人组织一进会作为统治工具。一进会由原东学党干部李容九在日本成立，李容九原本是持反日倾向的朝鲜人，但由于东学党起义受到李氏朝鲜政府打压，再加上日本势力强大而投靠日本。1905年11月，一进会宣布承认两次《日韩协约》合法有效，在谍报、军事运输、铁路建设等方面支持日本，同时约定帮助镇压反日运动。

一进会幻想利用日本人的支持发起暴动，废黜韩皇李，由自身成员组建内阁，在伊藤博文为首的朝鲜统监府的率领下实施渐进改革，组织“日韩合邦”。1907年2月2日，一进会的日本顾问内田良平向伊藤博文致函，提出利用一进会逼迫皇帝退位，之后再由朝鲜统监府代替李氏朝鲜政府施政，布告免税两年，最终再把一进会解散，如此便可以利用朝鲜人内部暴动瓦解李氏朝鲜体系。对于这个想法，伊藤博文并不完全支持，他依然认为日本应该处于“超然”地位，组建一个由朝鲜人领导的政府，以防朝鲜半岛民众把怒火对准自己。

不过一起“韩皇密使事件”却严重动摇了伊藤博文的决心。1907年7月，韩皇李密使来到海牙，准备以独立国家代表的身份参加第二次国际和平会议，遭到欧美列强集体拒绝入场。这起事件让伊藤博文非常警惕，于是主张“缔结更进一步的条约，让渡一些内政权利于我国”。于是在他的推动下，韩皇李哭在7月19日让位于太子李垠，同时24日签订第三次《日韩协约》，这一次李氏朝鲜政府明确提出“在改善施政方面接受统监的指导”，把内政治理权、法律法令颁布权全部让渡给日本。7月31日，朝鲜统监府除留下不足七百人的近卫步兵队外，韩军整体解散；8月，又任命一批朝鲜内政官员，包括内务部次官、农商工部次官、学部次官、法部次官、警务总长等人在内的职位均由日本人出任。

这起事件不仅动摇了伊藤博文的决心，也动摇了他在朝鲜半岛的地位。由于伊藤博文在日本逐渐被桂太郎等人架空，这一时期的伊藤博文力求在朝鲜半岛实现政治理想，即采取渐进手段让朝鲜半岛逐步纳入到日本的统治下。韩皇密使事件后，在朝鲜的日本各团体开始策划让伊藤博文下台，这个举动获得日本元老山县有朋的支持。于是1909年6月，伊藤博文辞去朝鲜统监职位转任枢密院议长，最终10月26日在哈尔滨火车站遭到朝鲜独立人士安重根袭击而去世。

伊藤博文退出历史舞台让日本吞并朝鲜半岛的速度进一步加快。1909年11月，一进会提出所谓的“日韩合邦”请愿书，这一点最初由当时的第二任朝鲜统监曾祢荒助驳回，首相桂太郎知悉情况后，迅速将他撤掉，任命内阁里的陆相寺内正毅在1910年5月成为第三任朝鲜统监，并迅速接受请愿书。

最终在1910年8月23日，韩皇李垠宣布接受合并，签署《日韩合并条约》，其中第一条即宣布“韩国皇帝陛下将关于全韩国之一切统治权全部及永久让给日本国皇帝陛下”。根据条约要求，韩皇家族以“李王家”身分进入日本贵族体系，并成为日本贵族体系中介乎于日本皇族与华族之间的“王公族”。

当年9月12日，在“日韩合邦”中起到关键作用的一进会遭到解散，日本政府发放十五万日元遣散费给九万二千名会员。对于这一点，李容九深感后悔与受骗，他拒绝日本政府给予的侯爵之位，最终在第二年5月郁郁而终。1910年成为朝鲜半岛历史上彻底沦为殖民地的起始之年，直到1945年二战结束为止，朝鲜半岛一共度过三十五年的被殖民时光。