如果当年崇祯南迁会得到拥护，那么是否能像南宋一样延续百年国运呢？这个问题难以回答，因为历史的发展往往是多方面的结果。

首先，我们需要知道崇祯南迁的原因。崇祯年间，明朝内外交困，政治腐败，社会动荡不安。而崇祯南迁的主要原因是为了避免被清军所俘，保护明朝皇室和文化遗产。如果崇祯南迁得到拥护，说明人民对明朝的继续存在还有信心，但是这并不意味着明朝能够继续延续百年国运。

其次，明朝的衰落已经是不可避免的事实。即使崇祯南迁得到拥护，也无法解决明朝政治腐败、经济萎靡、军队疲惫等问题。而且，清军的入侵已经一发不可收拾，即使崇祯南迁，也难以改变明朝的命运。

最后，南宋和明朝的历史背景不同，南宋的灭亡是由于内部的政治斗争和外部的入侵造成的，而明朝的灭亡则是由于内部的腐败、外部的入侵和农民起义三方面共同导致的。因此，即使崇祯南迁得到了拥护，也难以保证明朝能够像南宋一样延续百年国运。

综上所述，如果当年崇祯南迁得到拥护，也许能够延缓明朝的灭亡，但是无法保证明朝能够像南宋一样延续百年国运。历史的发展是由多种因素决定的，没有哪个单一因素能够决定历史的走向。