1976年，原福州军区司令因公罹难，军区工作由副司令代理。

按照一般情况下，大军区司令员的任命有两种，一种是空降干部；另一种是内部提拔。副司令提拔为司令员也不是不可，但在福州军区司令员的人选上，上级还是很重视的，需要有实力的将领坐镇。

1977年，几大军区级单位主官空缺，如南京军区、福州军区、成都军区、新疆军区，以及其他军兵种，如空军、铁道兵、二炮等。上级拟任南京军区副司令聂凤智为福州军区司令，可对方因身体不好，加上气候不适合，而改为南京军区司令。

上级原本任命第一副司令李水清为南京军区司令，聂凤智留南京军区，按说李水清是不是应该到福州军区任职。上级并没有这样安排，而是拟定为成都军区司令，后改而为二炮司令。福州军区司令员由第一副总长杨成武兼任。

福州军区自成立后，一直作为战略前沿，摆在很重要的位置。

1955年，六大军区改编为12大军区时，南京军区下辖江苏、上海、浙江、福建、江西、安徽等，而且还有很长的海岸线防守，军事职能非常重要。可在当时与台湾、金马、妈祖相隔最近的福建经常受到敌人袭扰。作为南京军区从战略指挥方面来说，显得有些鞭长莫及。或许因为这样，1956年将福建军区升格为福州军区，并在1957年将副总长韩先楚放在这里担任司令。

当时，叶飞担任省委第一书记，军区司令兼政委，而地方建设很重要，一个人身兼数职精力不够。把韩先楚安排这里，因为能打，而且解放海南岛时，他就是登陆最高指挥员，在四野，甚至全军将领中都是很能打的。

他坐镇指挥，不仅可以威慑敌人，也可以让敌人有来无回。

韩先楚担任司令长达16年，1973年12月调离。上级将兰州军区皮定均调来担任司令，皮定均在1969年之前一直在福州军区担任副司令，干十几年抓作战工作，军区的各个作战单位，以及防御都是一清二楚，而且也是很能打仗。把他调来，目的有二，一个是八大军区对调，第二要找熟悉能打的司令继续坐镇前线。

1976年，皮定均司令因公罹难。副司令暂时代理工作，并没有被提拔，或许因为分量不够。

1977年，上级准备调聂凤智，让他担任司令的原因，第一过去在福州军区空军担任过司令，熟悉福建的情况；第二他过去在空军指挥空战很有战绩，全空军中，找不到第二个像他指挥空军作战丰富的人，抗美援朝时期主要是他负责空战，刘震刚指挥时，还是小战而且时间短，他接替后大战。七十年代初期，他身体一度陷入非常危急的地步，后来身体好转一些，只可惜身体不好，只能作罢。

李水清过去在战争年代一直担任政工干部，解放后才成为军事主官，担任军长、军区副司令等职。

最终上级将杨成武调去担任司令，因为他军政都很优秀，打仗在上将中很有一套，曾经担任过军委办事组组长兼代总长。除了能打仗，会打仗，他还是福建人。而当时台海形势下，需要一位份量重的将领坐镇。

可以说，福州军区司令员并非谁都可以担任的，要看实力和能力。

1985年，随着军队精简裁员，福州军区与南京军区合并，组建新南京军区，新形势下新发展。