1977年，几个大军区级到单位主官空缺，上级进行调整，准备将南京军区两位副司令，李水清和聂凤智分别提拔为南京军区司令和福州军区司令。

据李水清回忆，自己作为南京军区第一副司令，上级拟任自己留南京军区担任主官，让聂凤智到福州军区，对方提出要求，说自己身体不能适应，希望留在南京。上级最终考虑，并采纳聂凤智到意见，而李水清没有到福州军区，准备拟任成都军区司令，后改二炮司令。

说到聂凤智过去在空军部队任职，担任南京军区副司令兼南京军区空军司令，也干过福州军区空军司令员，而他在空军的实战指挥经验是大家有目共睹的，从抗美援朝时期指挥空军作战，到一江山岛战役，再到此后针对国军空军袭扰大陆等，都被他狠狠痛击过。

实际上，当时聂凤智的身体也正如他所说的那样。

1973年，聂凤智的问题得到解决，但也病倒了。在此之前就因身体问题坚持着，如今都要到“最后的告别”了。北京的专家到后进行会诊，上级指示一定要枪击，要医生调医生，要药调药，就是国内没有，通过驻外使馆购买，由解放军总医院福州抢救。

止住肺炎，胃部大出血，专家们分析情况，找症结。最终进行手术，并多次进行手术，前后2个多月抢救，情况转危为安。此后近2年里一直是休养。

1975年，他想工作主动找上级，尽管身体情况不好还是想做点工作。没多久，急性胆囊炎发作，入院治疗，虽然问题不大，但也是身体的一种损伤。也就在住院期间，他被任命为南京军区副司令。

在工作中，也是拼命三郎的精神，但身体不允许过度操劳，一生病哮喘、肺心病并发。

1977年，在几个大军区级单位军事主官进行调整时，他一开始是空军司令员人选，不少人都推荐他，但他个人认为自己并不合适。

当时，空军、南京军区、福州军区、成都军区、新疆军区、二炮、铁道兵等大单位都换将。或许考虑他曾经在福州军区工作过，而且是一员战将，可以面对台海形势的变化。可他认为自己身体不合适，到福州适应不了，还是留在南京可以。

上级采纳了他的意见，最终留他担任南京军区司令，而拟任李水清的职务也进行改动，上级怎么没有让他担任福州军区司令？福州军区是台海形势的战略前沿，需要一位战将出任，上级最终考虑杨成武坐镇主场，可见有些军区主官的任命，还是看实力的。