太平天国极度仇视满人是人所共知的。在太平军打武昌时，就曾团灭湖北提督双福麾下的三千多八旗兵，满人几乎一个不留。打武穴时，两江总督陆建瀛派总兵恩长率四千清军驻守此地，其中有近两千八旗将士。太平军夜袭清军营地，见人就砍，特别是满兵一律格杀勿论，最终将恩长部数千人马悉数歼灭。恩长见全军覆没，悲愤投水自杀。

1853年2、3月间，太平军连破安庆、池州、铜陵、芜湖、和州。清军兵败如山倒，沿江设防的绿营、八旗兵勇不战而溃 ，长江两岸的天地会众及贫苦农民、渔民、工匠纷纷参加太平军。

3月，太平军陆师兵临南京城下。随后，水师舰船也接踵而至。陆建瀛身为两江总督，总管南京军事防御，却无谋无勇，只会粉饰欺君，面临如此危局，他竟闭门不出，束手无策。史载，他自武汉逃回南京后，即深居简出，终日焚香卜卦 ，三日不会客，不办公。在陆江督的影响下，江苏巡抚杨文定借口防守镇江，带亲信溜到苏州。不久，太平军在罗大纲、林凤祥、李开芳等猛将的率领下，一举攻破南京外城，斩杀陆建瀛。

南京城虽被攻克，但城中之城——亦称内城、满城，尚在八旗兵的控制之中 。南京满城是原明朝皇宫旧城，城垣异常坚固，防御设施齐备，易守难攻。因为太平天国以民族革命者自居，推行对旗人的无区别杀戮政策，只要你是旗人，不分军民官绅，不甄别老幼妇孺，一律诛杀。正因为如此，城中满人只得与太平军死战到底，人人俱怀必死之心，因此满城的战斗，血腥惨烈的状况前所未见。

东王杨秀清连续发动3次强攻，都被八旗将士挫败，被打死数千人，伤者难以统计，城下尸积如山，血流成河，尸堆几与城平。旗兵知道横竖是死，因此抵抗十分凶猛，但毕竟寡不敌众，抵不住太平军兵多将广的人力优势。

杨秀清命部队轮番冲锋，以不惜血本的车轮战消耗八旗兵，战斗持续了好几日，旗兵昼夜奋战，不眠不休，竟有人“力尽气竭而死”，杨秀清又打起了心理战，诓骗说凡缴械出降的旗人可以免死，旗人疲困不堪，听此一说，士气顿减。太平军 趁机发起猛攻，前仆后继，一举突破城墙。八旗主帅、将军祥厚见大势已去，毅然拔剑自刎，其麾下的将领均 被太平军斩杀，士兵也被围杀殆尽。

平定满城、团灭旗兵后，洪秀全下令，全城搜杀旗人，“有擒得旗人者，赏银五两”。于是城中的汉人居民纷起搜捕追杀满人，驻南京的两万多满族军民几乎被斩尽杀绝。

太平天国在付出数万将士生命的惨痛代价后，终于全面占领整个金陵城。之后，肃清残敌，恢复秩序，北王韦昌辉、东王杨秀清等簇拥着天王洪秀全浩荡入城。

1853年太平天国北伐军在北进途中也曾无差别屠戮旗兵及其眷属——1853年10月27日，北伐军费劲九牛二虎之力，终于打下沧州。在付出近四千将士生命的惨重代价下，方才拿下沧州。坚守沧州的八旗官兵及其家属全部被杀。血腥屠杀，解了太平军的心头之恨，但也把清军特别是旗兵推向了拼死抵抗的境地。在之后的各场战事中，清军将领常以南京、沧州血恨去激愤士气，使太平军重重受阻，作战更加艰难，常因满汉八旗兵的殊死抵抗，损兵折将而难于取胜。

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