二者在以下方面存在的区别如下：

定义及适用范围

资本溢价

资本溢价是指投资者缴付企业的出资额大于其在企业注册资本中所拥有份额的数额。

适用于有限责任公司。在有限责任公司中，新投资者加入时，往往需要投入比原股东在创立初期更多的资金，才能获得相同比例的股权。

这是因为企业在经营过程中积累了一定的声誉、客户资源、未分配利润等无形或有形的价值。

股本溢价

股本溢价是指股份有限公司溢价发行股票时实际收到的款项超过股票面值总额的数额。

专门用于股份有限公司。当公司发行股票时，如果股票的发行价格高于其面值，就会产生股本溢价。

例如，某公司股票面值为1元，发行价格为5元，每发行一股就会产生4元的股本溢价。

形成原因

资本溢价

有限责任公司在创立之后，经过一段时间的经营，会产生留存收益（包括盈余公积和未分配利润），同时企业的品牌价值、市场份额等也可能提升。新投资者要加入，需要对企业的这些增值部分付出代价，所以其出资额会大于在注册资本中所占份额，形成资本溢价。

例如，一个有限责任公司注册资本为100万元，经过几年经营，企业净资产达到150万元。此时新投资者若想获得20%的股权，可能需要出资40万元，其中100×20% = 20万元计入注册资本，剩余20万元就形成资本溢价。

股本溢价

股份有限公司发行股票时，考虑到公司的预期收益、市场行情、同行业公司估值等因素，可能会以高于股票面值的价格发行。投资者愿意以高于面值的价格购买股票，是期望从公司未来的利润分配或者股票增值中获利。

比如，一家股份有限公司首次公开发行股票，股票面值为1元，由于公司所处行业前景广阔、业绩预期良好，以每股5元的价格发行，发行量为1000万股，那么股本溢价为(5 - 1)×1000万= 4000万元。

会计处理

资本溢价

在有限责任公司，当新投资者投入资本产生资本溢价时，会计分录为：

借：银行存款（实际收到的出资额）

贷：实收资本（在注册资本中所占份额）

资本公积-资本溢价（实际出资额与所占份额的差额）

股本溢价

在股份有限公司溢价发行股票时，会计分录为：

借：银行存款（实际收到的款项）

贷：股本（股票面值×发行股数）

资本公积-股本溢价（实际收到款项与股本的差额）