陆军第一镇的前身称“京旗常备军”，与“北洋常备军”同时创办。光绪二十七年（1901年）九月，直隶总督李鸿章死，袁世凯继任，为贯彻“整军经武”，开始创建北洋常备军左右两翼。二十八年（1902年）五月，上谕提出在旗兵中亦改行编练新军，“挑选八旗壮丁”，交北洋大臣袁世凯训练，“年龄限在十六岁以上，二十二岁以下。”十一月初八日上谕又命令在挑选万余以上的八旗兵丁中先派3000人，“交袁世凯认真训练，期成劲旅。”二十九年（1903年）五月一日有千人学习期满，编成“京旗常备军”，由铁良会同袁世凯负责训练。

同年，十二月二十七日袁、铁二人会奏称：挑选的八旗兵丁3000人按《北洋常备程》，编成步队4营、过山炮队1营、马队1营、工程队2队，所需将弁，“在北洋各军将领及满汉武备卒业学生内”择优挑选。按章规定常备军一协营制“再添步队两营、陆路炮队1营、配足工程队为1营，合共步队6营、炮马队各两营、工程队1营。”以后又陆续增加。

光绪三十一年（1905年）五月，练兵处奏请全国新军统一番号，自第一镇至第三十六镇，“京旗常备军”改为“近畿陆军第一镇。”下辖2协，每协2标，每标4营，另外有马队、炮队各1标，工程队1营。

凤山

统制

凤山（光绪三十一~三十三年正月），汉军镶白旗，举人出身。宣统三年（1911）授广州将军，赴任途中被革命党人炸死。

何宗莲（光绪三十三年正月任；民国成立后改任师长），山东平阴人，北洋武备学堂毕业。1914年因镇压察哈尔新军兵变不力，被免去师长职。

曹锟

第一协协统

曹锟（光绪三十一~三十三年，正月改任第三镇统制），直隶天津人，北洋武备学堂毕业。袁世凯心腹，后为直系军阀首领，并当选第五任中华民国大总统（1923年10月10日-1924年11月2日）。

李奎元（光绪三十三年正月任），直隶武清人。

第一标统带

李焕章（民国元年改任第一旅旅长）

第二标统带

周符麟（光绪三十一年六月任）

何宗莲

第二协统领

何宗莲（光绪三十二年任；三十三年正月改任统制）

朱泮藻（光绪三十三年~民国元年七月），山东人，北洋武备学堂毕业。

第三标统带

宫长滩（民国元年任团长）

第四标统带

王同玉（光绪三十一年四月任）

何丰林（光绪三十一年任；同年调第十三标统带），山东平阴人，北洋武备学堂毕业。

于有富（民国元年七月升第二协统领）

王怀庆

马队第一标统带

王怀庆（光绪三十年任），直隶宁晋人，北洋武备学堂毕业，徐世昌心腹。

孟效曾（民国元年任团长）

炮队第一标统带

昆福（宣统三年任）

工程队第一营管带

李誉俊（宣统三年任）