因为嘉靖够聪明。

他可不想当朱祁镇第二，他太清楚杀了海瑞的后果是什么了。杀严世蕃是情势所逼，由裕王背书、清流派领衔的倒严已经大势所趋，况且国家混乱、朝政一潭死水，舆论需要一个宣泄点，不杀严世蕃阻挡不了清流们的动作，朝政也稳定不下来。而海瑞呢？除了嘉靖为了自己的面子，以及陈洪和赵贞吉为了讨好嘉靖，还有其他人想杀海瑞吗？

要知道给海瑞定罪的时候，徐高张三位老油条定的可是“儿子辱骂父亲的罪名”，最终杀海瑞与否这个球还是踢回给了嘉靖。

所以，从权衡利弊出发，杀海瑞有弊无利。而具体原因在于：第一、海瑞《治安疏》中说到的问题基本属实，杀了他，海瑞流芳千古，嘉靖彻底坐实昏君的骂名；第二、海瑞是一把利剑，留着他可以给裕王带来帮助。嘉靖三十九年冬，入冬后都不下雪，一时间人心惶惶。要知道一冬不下雪，对于缺少农药化肥的古代农业来说无疑是毁灭打击。

缺少了大雪冰冻覆盖，来年虫蝗必然大作，而送往京师的回报中都是不好的消息：山东无雪，山西无雪，北直隶无雪！

天干物躁的季节，恰好嘉靖一意玄修的万寿宫又着了一场大火，加之朝廷财政连连亏空赤字，北京各个衙门京官俸禄已经拖欠了几个月，百官之中怨言不断。

一时间天灾、火灾、人灾等事，把连续二十年不上朝的嘉靖皇帝置于风口浪尖之上，嘉靖无奈只好召见了钦天监周云逸，想让周云逸以专家身份鉴定腊月不下雪与人事（内廷敛财，严党贪鄙）并无关联。

结果周云逸借天象说：“宫内（指嘉靖）开支无度，阁衙上下贪墨，国库空虚，民不聊生，这是上天示警！”

周云逸一句话，算是把二十年玄修的嘉靖的“功业”彻底否定了，气呼呼叫东厂的人把周云逸拖到午门杖击二十（打屁股）。

但在发火同时，嘉靖怀疑周云逸背后有人指使，于是让东厂提督太监冯保去施刑审问。

还有一个背景的原因就在于：海瑞上书其实选择了一个绝佳的时刻。这时候没有能给嘉靖背锅的人了，严嵩和吕芳已经不在了，而嘉靖此刻精力也大不如从前，手下的人就连陈洪都开始巴结裕王。说白了，这是嘉靖一朝皇权最为松动的时候。

海瑞选择此刻上疏，朝中大臣和司礼监有谁能去为嘉靖挡这个骂名呢？徐高张注重名誉，断然不会去趟这浑水；赵贞吉有成为第二个严嵩的潜质，可以资历不够，还被海瑞扒出了老底；陈洪按道理可以，可是定罪还轮不着司礼监，况且海瑞背后曾经连着裕王，这个时候冲出去接刀子，以后裕王上位了要是清算起来怎么办？

所以，嘉靖只能自己出动，可最终也只留下八个字“无父无君，弃国弃家”，让内阁定罪，结果也是扯皮，不了了之。还是靠着嘉靖“好雨”、“明月”的旨意才给了徐高张一个提示。

海瑞最终得以保命，看似是刚正不阿感天动地，其实背后夹杂了天时地利人和。

越中四谏、戊午三子，沈链、杨继盛，等等，嘉靖杀的人还少吗？可是动手的人是严嵩、作恶的是严党，他嘉靖是可以躲在后面自我催眠的。就是因为他太聪明了，他太清楚如果这些人是直接死在自己手里的话，他会是个什么下场。

等到海瑞上治安疏，严党没了，没人替他干脏活了，要杀海瑞就必须自己亲自动手，那他可得好好想想了，聪明的他很清楚这意味着什么。要知道那是大明朝，嘉靖可是迷信地很，他信求仙得道、更信死后要跟列祖列宗汇报工作，现在这么一个大忠臣让他给杀了，在上面的满天神佛还会准他的修仙申请吗？在下面的列祖列宗会饶了他吗？

嘉靖也不是没有做尝试，他试图逼着满朝文武去做严党的工作。先是让内阁领着三法司过堂，一般来说严党还在的时候，走到这一步程序事情就可以有结果了，严党屁颠屁颠地颠倒黑白判个死刑，嘉靖装模作样地表演被蒙蔽后勾朱杀人，大家心照不宣地把想弄死的人给办了。结果三法司没拦住人家也不想拦，所有人都知道这时候宁肯强行中立、对皇帝阳奉阴违也不能站到海瑞的对立面，这是要上史书的，万一应对不当那煌煌史册上可就要现了大眼儿了。

嘉靖一看正常程序走不通，让内阁领着言官御史以及国子监接着上，要从道德上把海瑞批倒批臭，这样也能找到借口干掉海瑞，虽然手段下作但起码圆地回来，这样嘉靖仍然能自我催眠。结果这帮文官也不是省油的灯，除了一句“子骂父、臣骂君当然不对”用来应付交差外一点锅都不接，我们不说海瑞做的对，但这只是出于“天地君亲师”的伦理纲常，我们实际的想法是什么，您猜猜？

到这里，嘉靖就已经确定，他要在自己的名声和海瑞的命之间二选一了，想要海瑞的命就必须自己亲自动手，陈洪倒是跃跃欲试却让嘉靖给喷了，陈洪动手和他嘉靖动手有什么区别？赵贞吉倒是想逢迎上意更进一步，结果让海瑞一顿操作直接社死、官声名声身前事身后名全赔进去了，自己要是下了手估计好不到哪儿去。

等到嘉靖和海瑞在大牢里一番较量后，就更不能杀了，这时候杀海瑞连他自己心里的坎儿都过不去了。