在本轮军改中，北京卫戍区、新疆军区和西藏军区是仅剩的3个仍设参谋部、配参谋长的省军区。特别是对于副战区级的新疆军区而言，由于其以防卫作战为主业，且下辖了大量野战部队和边防部队，所以参谋长作为各级军事指挥部门的首长，职责重大、作用突出。

目前，新疆军区的参谋长共有6个等级，分别是：

一、正军级：新疆军区的正军级参谋长只有一个，即新疆军区参谋长，少将军衔。

二、副军级：新疆军区的副军级参谋长也只有一个，即南疆军区参谋长，少将军衔。（南疆军区是隶属新疆军区的一个正军级军区。）

三、正师级：新疆军区的正师级参谋长只有一个，即兵团军事部参谋长，大校军衔。（兵团军事部是隶属新疆军区的一个副军级单位，相当于新疆生产建设兵团的“省军区”。）

四、副师级：新疆军区的副师级参谋长有很多，包括4个合成师的参谋长、15个军分区的参谋长等等，大校军衔。

五、正团级：新疆军区的正团级参谋长也有很多，如陆航旅参谋长、特战旅参谋长、炮兵旅参谋长等等，上校军衔。

六、副团级：新疆军区下属的各边防团、合成团、火力团、汽车团、炮兵团等单位的参谋长都是副团级，中校军衔。

此外，在新疆军区序列下有诸多合成营，这些合成营因为规模较大、武器类型多且由多兵种合成，所以还设有“首席参谋”一职，类似于合成营的参谋长。合成营首席参谋至少是副营级，部分则是正营级，其职责是协助合成营营长进行作战指挥、部队调度和战场控制！合成营首席参谋领导管理着火力参谋、战勤参谋、情报参谋、作战参谋等参谋人员，因此并不是“孤军奋战”！

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