1967年，担任东海舰队政治部主任11年的李长如，被调任到国家海洋局政委。看似离开海军部队，实则并非如此。
如今的国家海洋局与过去都是国务院直属局，但从1964年成立后，一直由海军代管。因此领导都是海军出身将领担任，如局长齐勇是原南海舰队副司令员，李长如是东海舰队政治部主任，而国家海洋局属于高于厅局级，低于正部级，属于副部级单位。
齐勇、李长如所在原单位不管是南海舰队，还是东海舰队，以及北海舰队在当时都是兵团级单位，他俩也都是副兵团职。
很多人不清楚，为什么海洋局要让海军代管。
海洋局成立后，但负责海军调查和科研，如海洋水文，海洋气象、地质、地震观察、海水淡化、能源、化学、生活等研究。甚至在70年代，国家为发展航天事业，要向公海发射洲际火箭试验，需要海洋局调查远洋资料等。海洋局大部分人员都是现役军人，任务是国民经济服务，也为国防建设服务。
海军代管海洋局15年，直到1980年上级决定海洋局改为国家科委代管，原在海洋局工作的现役军人，团以下干部脱下军装就地转业到海洋局工作，师以上现役军人干部可以选择回海军国共内战，李长如选择回海军。
他被任命为北海舰队副政委，从职务来说，也13年前离开时，晋升了一级。北海舰队的政委是康志强，是原东海舰队政委，如今俩人依然搭班子在一起工作。当时北海舰队有6位副司令，3位副政委，很多人都是老朋友，老同事。
当时已经六十多岁的他，跟老首长说自己一定会做好分管工作，站好最后一班岗，康政委说：你比我小几岁，不能说就是最后一班岗。或许认为他还有进步空间吧。因为在2个月后，他就被调党校学习了。
几个月后，重返舰队工作没多久，康政委调任海军副政委，李长如接替北海舰队政委，成为正兵团职，在北海舰队工作2年。1982年军队提出干部年轻化，专业化，知识化，革命化的号召，不少老将纷纷退居二线或者离休，而且给设置年龄，但65岁没有特别情况都会转到二线或者离休。
1983年，66岁的他，在北海舰队工作7年的他，退居二线。
