一、“旷工一天扣三天工资”是否合法？

《劳动合同法》第30条规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。劳动者工作一天即可获得一天的工资，旷工一天，用人单位可不支付当天工资。但若旷工一天就扣三天工资，多扣的两天工资实际上是其他正常工作日的工资，用人单位这么做涉嫌克扣工资。因此，用人单位在公司规章制度中规定“旷工一天扣三天工资”没有法律依据，系违法规定。

二、“旷工一天扣三天工资”的法律风险

《劳动合同法》第38条的规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的；用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的，劳动者可以解除劳动合同且可以要求用人单位支付经济补偿金。所以用人单位在制定规章制度的时候需要注意，需要做到既合法也合理。否则在发生劳动争议时很有可能会因为制度违法或不具有合理性而不被司法机关所采纳。