1865年2月 ，屡次挫败李世贤的清军将进攻的矛头调转向汪海洋。2月28日， 楚军大将刘典和王德榜派兵堵击汪海洋。3月1日深夜，汪海洋主动放弃其大本营南阳乡，退守上杭县城。刘典、王德榜穷追不舍，督军围攻上杭城，汪海洋军不支溃败，又逃奔永定。几乎与此同时，楚军将领刘明珍等率众由漳平进至南路之永福里，于3月1日突袭原花旗将领丁太阳扼守的太平军营垒，连破数垒，次日乘胜进攻，丁太阳部溃败。入援福建的粤军在方曜的率领下与汪海洋军激战于石碣，汪海洋再次失利退走。至此，汀州全境被清军收复。

兵败石碣后，汪海洋率领太平军主力退到南靖、永定、龙岩三县交界的奎洋、苦竹、梅林一带休整；李世贤则率所部残兵败将苦守漳州，还分出部分兵力驻守云霄等地，他还在漳州东北一带挖壕筑垒，企图袭扰清军后路。这时，刘清亮率部抵达江东桥，进屯北溪；黄少春部进驻北尾桥；高连升则率部进驻漳州东50里处的好景山，各军彼此联络，相互策应，对困守漳州的李世贤残军形成包围之势。从3月底到4月初，李世贤多次派兵出城主动迎击，与清军对战，皆遭失败。

4月11日，汪海洋从南靖派来部分援兵，李世贤见援军抵达漳州外围，立刻率守军出城与其合击围城清军。说来也巧，就在李世贤率军大举出击时，李鸿章派来赴援的十营淮军正好在福建陆路提督郭松林的率领下赶到漳州城外，于是派出5营兵力配合高连升部迎击太平军；（铁马冰河wu）福州海关税务司的英籍税官梅理登也从厦门拖来几尊开花大炮助战。太平军倒也不怂，将士皆浴血拼杀，但毕竟力不如人，在楚军、淮军、洋人的猛烈进攻下伤亡惨重，李世贤只得引败军退入城里。汪海洋派来的援军也吃亏不小，余众随李世贤一同退守漳州。

退至龙岩一带的汪海洋也屡屡遭到清军的围攻。4月9日、10日，王德榜、刘清亮接连两日率部与太平军交火，并一举攻占吴仓、吴溪一带的好几座太平军营垒。刘典侦知汪海洋部太平军主力分别驻扎在奎洋、梅林等处后，命裨将带兵进击，汪海洋猝不及防，稍事抵抗即率军撤走。

左宗棠认真分析战场形势后认为，汪海洋很可能率部退回江西，李世贤则“志在入海”。当时，江西已有两万清军防守，可以高枕无忧。于是，他下令水师舰船加强巡逻，尤其要注意对诏安铜山、漳浦碴口一带海面及港口、码头的监控，并派淮军杨鼎勋部驻守石码（福建龙海石马镇）、海澄，严防李世贤残军南下漳浦并逃往海上。随后，他又派福宁镇总兵刘明灯率5营兵马驰援安溪、华峰司，以守护进攻漳州各军的后路。

5 月5日，刘典率军猛攻梅林、奎洋等地，汪海洋部再次大败 ，死伤颇重，旋即退出福建，撤往广东嘉应州（今梅州）大埔一带。与此同时，淮军郭松林、杨鼎勋部从南，楚军王德榜、刘清亮部 从北 ，夹攻漳州 。李世贤督军死守，并分兵出击，皆被清军击败。5月9日，左宗棠自延平赶到福州。

5月15日，高连升远眺漳州乌门，见乌门与城东北楼内的太平军营寨形成掎角之势，灵机一动，认为若要攻克漳州城，必须先摧毁楼内营寨。他与刘清亮、王德榜、郭松林、杨鼎勋等人议定，各军明确分工，兵分数路，分进合击。也是老天暗助，当日刮起了大风，清军顺风点火，火借风势，吞噬一切，很快延烧至漳州外城，将部分太平军逼出城。高连升见火攻奏效，立即趁势率部登城，入城后又打开城门放大队人马冲入，李世贤督军拼死与清兵巷战，巷战激烈而残酷，太平军不敌，战死者甚多，李世贤率众血战多时仍处下风 ，感觉大势已去，无取胜希望，被迫率残部且战且走，从西门溃围而出，仓惶逃往南靖。至此，太平军余党在闽南的重要据点漳州被清军收复。

5月16日，南靖也被紧追不舍的王德榜、刘典军攻破。李世贤被迫率残兵败将继续向西奔逃，王德榜不依不饶，率部自南靖一路跟踪追击。次日，清军在羊城、林浦一带追上了太平军，两军旋即展开两场恶战，李世贤部因接连兵败魂魄已丧，均遭失利，只得逃出战团，继续往平和方向退却。高连升、刘清亮、黄少春率军赶至，尾随太平军紧追不舍。眼看清军进逼平和城，李世贤料不能敌，只能率残军绕城而走，结果慌乱中连人带马跌落桥下，受了重伤；朱兴隆、陆顺德率守军从平和城内西门撤出，平和被清军克复。同日，郭松林、杨鼎勋率淮军攻占漳浦，太平军守兵死伤惨重，残余兵众四散逃逸。

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