李自成攻占西安后， 把这座十三朝古都又改回原名长安，设置、命名官署都按照唐朝旧制。西安本就是帝王之都，经历朝历代不断修缮，城墙巍峨高耸，坚不可摧， 号称固若金汤 。李自成本是陕西人，对西安感情自是不一般。为了将西安建成自己的大本营以及后方基地，李自成开始大兴土木，他招徕大批工匠，对西安城进行大规模改造，对城墙进一步加固、完善，还挖深、加宽了护城河壕渠， 使西安城墙比之前更牢不可破，远观犹如铜墙铁壁，雄峙关中。比以往更加壮丽 。

在没有战事之时，军队就要加紧训练。李自成每3天就要去大校场（演兵场）校射一次。《甲申小记》说彼时的他身穿蓝色布袍，有卫士为他撑把小黄伞，骑着高头大马，身后还有亲兵跟随，张着几面黄龙旗，煞是威风。长安百姓远远望见黄龙旗，就知道是李自成要过来了，都要赶紧避开让道。

由于陕西是李自成的原籍，所以他对麾下将士 严格约束，比在别处要严厉得多，他规定：

“所过村镇，慰谕父老，戒有所侵暴”。

对于那些富豪缙绅，李自成可就没那么客气了。进入西安后，李自成有几十万大军要养活，数十万人吃喝拉撒，每日耗费是一笔天文数字 ，这么多钱从哪来？有人给他出主意，向富人“追赃助饷”。（铁马冰河wu作品）李自成知道这些富绅都不愿归附自己，有人背地里还咒骂自己为“闯贼”，况且自己不愿骚扰早已穷困不堪的乡党百姓，从不向秦川父老征敛，就只得从这些豪门大族身上打主意、刮油水了。

李自成将一些明朝旧臣和门第显赫的富商地主召来，让他们捐献些财物以充军饷供养军队，对那些不愿交或不能如数交纳者，则拘押起来，每日严刑拷打，逼迫其家人如数交纳。有不少人熬刑不过，被折磨致死。譬如《绥寇纪略》就说，听说渭南南氏家族世代为官，富甲一方，李自成逼其交纳饷银160万两，已经致仕（退休）的原礼部尚书南企仲已经83岁高龄，因拒不缴纳，被追逼拷掠而死。其子南居业刚举进士不久，还没出仕，居业的堂哥南居益曾任工部尚书， 均遭抓捕逼捐，“皆被炮烙（商纣王发明的酷刑：在铜柱上涂油，下加炭使热，令有罪之人行其上，辄坠炭中活活烧死 ）死”。

类似的“追赃助饷”事件不胜枚举，许多高门大姓者因农军逼捐不交而被拷掠致死，关中大地怨声一片。史载，因拒交饷银而被农军拷打致死者太多，李自成下令挖一大坑埋之，填土后用马踏平，家人连尸首都找不到。

李自成用严刑峻法追赃助饷的做法过于严酷，由此在舆论上陷入不利境地，也使许多明朝的官绅对他恨之入骨。

李自成进占西安后，经过短暂的休整及筹集军饷，马上兵分三路攻掠三秦大地，追剿明军残部，以巩固自己的大后方。

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