至东汉初，行政区划发生了较大的变化。南改广陵国为广陵郡，北废泗水国并且西撤临淮郡在其故地设下邳国。这样，本同属临淮郡的淮安诸县被分开：淮阴、淮浦、盱眙属下邳国;射阳、盐渎、东阳(含富陵)属治于今扬州城北的广陵郡(图4)。

图4：东汉(公元140年的淮阴县及其附近)

　　至此，从秦初最早设置的淮阴县算起，到东汉末已有近500年，然淮安境内却没有出现特别重要的聚落。前文已述，古淮安地处淮水、泗水尾闾，战略位置十分重要。淮水是我国古“四渎”之一，古淮水在今淮安境内的走向大致是出盱眙城东北流入洪泽湖，再东北流经码头--杨庄一线，杨庄以下的废黄河也即宋元后被黄河所夺的古淮河。而泗水发源于鲁西南的沂蒙山区，东南流经徐州，徐州以下到杨庄的废黄河也即古泗水河道。而鲜为人知的是，泗水作为淮水北岸的支流，在晋代前后入淮口并不一致，我们现在所说的泗口，即古泗水入淮口在今码头镇西北，然东汉以前却是在码头西数十公里，约今泗洪县最东端的位置。泗水直到汉末才改道古淮阴县码头附近入淮，先前淮泗二水并不在淮阴汇聚，此为原因之一。二来当时黄河下游与江淮间的水运交通，除走泗水，更常用的还是西面的涡、颍水到合肥一路，因为这对政治中心在长安、洛阳的两汉政权来讲更便捷。

　　东汉末天下大乱，诸侯割据。广陵郡治先后迁至射阳和淮阴。三国时，东吴和魏大致以长江划界，但东吴的实际势力往往达到沿江北岸。于是就出现了魏和东吴南北广陵并存的局面。治于淮阴的北广陵郡最初辖淮阴、淮浦、凌县、海西四县，淮水之南基本“有地无民”，县治皆废。后曹魏越淮屯田，养精蓄锐，逐步兼领了淮南东阳等县，势力所及直至今高邮县境。

　　司马氏篡权后，吴魏对峙转为吴晋对峙。不久，公元280年，西晋平吴。2年后，南广陵并入北广陵郡，“广陵太守治淮阴故城”，辖有9县：淮阴、淮浦、射阳、盐渎、广陵、海陵、高邮、舆县。而盱眙、东阳划归临淮国，凌县泗阳则属下邳国(图5)。

图5：西晋时的广陵郡