羌活散寒除湿，温通血脉，且止痛效果好，所以常用于身体疼痛的治疗。如《本草品汇精要》记载羌活：“主遍身百节疼痛，肌表入风贼邪，除新旧风湿”，为治疗风寒湿痹阻疼痛的重要药物。且书中记载羌活“直上巅顶，横行肢臂......专主上部风寒湿痹”，所以临床上部疼痛多用羌活。羌活既能发散表邪，又能祛风湿，止痛，所以对风寒湿偏重的痹症或痹症初期兼有表证者，最为是适合。通过适当配伍，也可用于湿热痹症。

羌活也是治疗头痛的常用药物，羌活具有升浮之性，上达巅顶，祛风除湿止痛，对于风寒、风湿、痰浊、瘀血等多种原因所致的头痛均有良好疗效。治疗风寒头痛多配伍川乌、细辛（注意川乌、细辛有一定毒性，使用注意控制剂量和疗程以及煎服方法）、白芷、藁本、川芎；治疗风热头痛，可以配伍蔓荆子、黄芩、天花粉、黄连、菊花、薄荷、荆芥、川芎等；治疗肝风挟痰所致头痛，可以配伍天麻、制南星等；治疗血虚头痛，可以配伍熟地、当归、白芍等；治疗痰浊头痛，可以配伍白芷、制半夏、制南星、茯苓、陈皮、泽泻、白术等；治疗瘀血头痛，可以配伍桃仁、川芎、天麻、僵蚕等。

羌活有通畅血脉、舒筋活络之效，有助于疮痈肿毒的消散，并有直接的止痛效果。所以治疗疮痈肿毒可以配伍清热解毒、活血化瘀的中药同用，去性存用，达到消疮止痛的效果。如《本草正义》的记载：“若外疡之属于湿热者，苟肿势延蔓，引及骨节筋肉伸缩不利，非以羌、独之善走宣通为治，则效力必缓，故虽热病，亦不避用......”，文中说的羌、独指的就是羌活和独活。

羌活配伍乳香、没药、桃仁、红花、当归、牛膝等药物，也可以治疗外伤疼痛。

羌活内服或研成粉末外搽牙龈也有治疗牙痛的作用，常常配伍龙胆草、升麻、防风、白芷、细辛（注意细辛有一定毒性，使用注意控制剂量和疗程）等同用。

羌活通过配伍也可以治疗皮肤瘙痒症，《药性论》记载羌活治疗“多痒血癞”，可以用于治疗风寒湿外郁肌肤引起的隐疹和其他皮肤瘙痒症。治疗皮肤瘙痒多配伍白鲜皮、地肤子、蛇床子、苦参、僵蚕等同用。

羌活也常用于眼科疾病的治疗，如《日华子本草》记载羌活治疗“目赤肿痛”，《本草汇言》记载羌活“目证以之治羞明隐涩，肿痛难开”，治疗眼科疾病，常常配伍防风、荆芥、蔓荆子同用，羌活祛风、胜湿，又能通畅血脉、升阳气，通过适当配伍可以治疗不同原因导致的眼病。眼病中畏风怕光、发痒、流泪、沙涩，可以通过羌活祛风作用治疗；眼睑及内外眦糜烂、湿痒肿胀，可以通过羌活祛湿作用治疗；眼病红肿、瘀滞、结块者，可以通过羌活温通作用消散；眼病疼痛者，可以通过羌活止痛的作用缓解；气血不能上注于目者，羌活可以升阳帮助气血上达眼睛；眼睛翳障者，可以通过羌活辛散、温通的功效帮助其消散。不同情况羌活需要配伍不同中药治疗，不过羌活辛温苦燥且性味雄烈，对于阴亏、燥热所致眼病需要慎用。

唐宋时期羌活还广泛用于治疗中风，《药性论》记载羌活：“治贼风失音不语......手足不遂，口面歪斜”。但金元以来，羌活治疗中风逐渐少用。近现代依然有羌活治疗中风的记载。

羌活还有通阳助孕的作用，如《傅青主女科》中记载的保产无忧散和保产神效方，均是羌活与黄芪、当归、白芍、菟丝子等配伍使用。也有医家在补肾药中加入少量羌活治疗男性性功能障碍、不育等。妊娠期较为特殊，用药还是需要在医生指导下用药。