蓝藻常常被认为是“有害藻”，主要由于一般水体容易形成蓝藻水华。

蓝藻水华具有三个特征：

一是蓝藻疯长，并抑制其他藻类生存生长，使蓝藻“一藻独大”；

二是疯长的蓝藻整体老化并大量死亡；

三是水体生态系统中藻类所具有的生态功能大大降低或丧失。

在夏秋高温季节，光照较强时，藻类增殖旺盛，消耗着大量的营养元素，致使上表水层的光照层，呈现高水温、高pH的同时，出现局部营养元素缺乏的现象。

由于蓝藻具有明显的竞争优势，致使其他藻类无法与蓝藻竞争，难以生长，使蓝藻“一藻独大”，这就是蓝藻水华的前期。

这里还需要强调的是水温造成的水体上下分层现象，致使上下水层难以交流，中下水层（包括底泥）营养元素难以补充到上表层。

蓝藻的“疯长”致使水体上表光照层营养元素进一步大量消耗，营养元素很快又成为蓝藻自身的限制因子时，导致大量的蓝藻整体老化，进一步就是大量死亡，这就是蓝藻水华的暴发。

杀蓝藻之前用的最多的就是硫酸铜，但是副作用太多，现在很少用了，现在用的比较多的就是有机酸，或者乳酸菌菌液。

这两种作用机理就是破坏蓝藻适宜的碱性环境，抑制蓝藻生长，主要还是作用于蓝藻刚起来的前期效果不错，但是对于已经出现大面积漂浮在水面的蓝藻作用不是太明显。

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