当网站遭遇木马攻击并被篡改时，这对于网站管理员和运营者来说无疑是一场噩梦。木马病毒不仅破坏网站的正常运行，还可能导致敏感数据的泄露，给用户带来损失，同时也损害网站的声誉。面对网站中木马被篡改反复的问题，我们需要采取一系列的措施来彻底修复，确保网站的安全与稳定。

接下来，进行全面的安全评估与漏洞扫描。使用安全狗云磐防护软件对整个系统进行全面的安全评估，找出可能导致入侵的安全漏洞。这包括检查服务器的日志文件，寻找可疑活动的迹象，比如异常登录记录、未知进程运行等。这些日志记录对于定位问题来源至关重要。同时，利用网站安全扫描工具检测所有可能的安全漏洞，包括过期的软件、弱密码、配置缺陷等。

根据安全评估的结果，修补所有已知的安全漏洞。这包括及时更新所有软件、插件、主题到最新版本，并强化代码安全性，以防范未来可能的攻击。对于被篡改的页面和功能，要全面排查，确保找出所有受影响的区域，避免恢复后遗漏潜在威胁。如果发现有木马病毒，要定位到木马的位置以及来源，对其进行强制删除，对进程进行修复，防止木马自动运行。

在修复过程中，如果有完整的备份文件，优先通过最新的备份恢复网站。在恢复之前，务必进行全面的安全扫描，以确保备份文件未被篡改。如果没有安全的备份，则需要手动修复受损的文件和数据库。这包括重新上传干净的代码、修复被篡改的内容，或在必要时重建数据库，以确保数据的完整性。

除了上述措施外，加强网站的日常监控也是防止木马病毒再次入侵的关键。使用监控工具持续跟踪网站的运行状态和安全状况，确保在事件发生的第一时间检测到异常活动。同时，配置自动警报系统，一旦发现潜在的安全威胁即可立即通知管理员，有效提升响应速度。

为了进一步提升网站的安全性，可以考虑安装防火墙和入侵检测系统。部署硬件或软件防火墙来监控进出服务器的流量，并设置合理的规则阻止未经授权的访问。同时启用入侵检测/防御系统（IDS/IPS），以便及时发现并响应潜在的攻击行为。此外，限制物理访问权限也是保护服务器安全的重要手段。对于托管在本地数据中心的服务器，应严格控制机房出入人员，只有经过授权且具备专业知识的员工才能接触核心设备。

在密码管理方面，要确保所有账户使用强密码，并启用双重身份验证（2FA），增加账户安全性。对于管理员账号，则需采用更加复杂的认证方式如多因素认证等。同时，采用HTTPS协议加密通信，通过SSL/TLS证书实现客户端与服务器之间的数据传输加密，防止敏感信息被截获或篡改。

在代码层面，编写安全的代码也是防止木马病毒入侵的重要一环。遵循最佳实践开发Web应用程序，避免使用存在安全隐患的函数库或者框架。定期审查现有项目代码，查找并修正潜在的弱点。此外，利用Web应用防火墙（WAF）可以有效地阻挡SQL注入、XSS跨站脚本攻击等多种常见威胁。

为了应对未来可能的攻击，建立应急预案也是必不可少的。制定详细的应急响应计划，包括入侵检测、分析、隔离和恢复步骤。确保团队成员能够迅速而有序地执行。通过模拟演练确保团队熟悉应急流程，提高应对实际突发事件的能力。同时，组织针对全体员工特别是IT部门成员的安全意识培训课程，教授他们识别钓鱼邮件、恶意链接等基本技能。

最后，保持与网络安全行业的最新动态同步也是非常重要的。关注行业动态，了解最新出现的攻击手法和技术趋势。利用第三方工具定期扫描整个网络环境，寻找可能存在的风险点。同时，遵守当地法律法规关于个人信息保护的规定，比如欧盟GDPR通用数据保护条例等。在收集处理个人数据的过程中保持透明公开的态度，增强公众对企业的信任感。

综上所述，面对网站中木马被篡改反复的问题，我们需要从隔离受感染网站开始，全面评估损失、分析攻击方式，然后恢复网站、修补安全漏洞，并持续加强安全防护。通过制定应急响应计划和强化团队安全意识，网站将更具防御能力，避免未来的攻击威胁，确保网站的长久稳定和安全。