亚历山大大帝去世时年仅33岁，其死亡原因一直是个未解之谜。临终时：“五月二十九日，他躺在浴池里高烧不退。次日洗完澡回到卧室，和米迪厄斯摇了一天骰子。晚上沐浴，祭祀，吃饭，发烧整夜，在五月三十一日，照例沐浴，祭祀，然后在洗澡的时候，倾听尼尔朱斯的故事。六月一号的发烧更严重了，睡了一晚，第二天也一直在发烧。他吩咐把一张大床搬到大澡盆边，和众将商议军队中的缺位，并从各人中选出填补。

到了六月四日，他的病情更加严重了，必须被人抬到室外去做祭祀。六月五日，他被带到幼发拉底河对面的宫殿里，在那里打了个盹，但一直到六月六日，他发烧并说不出话。这时，马其顿人以为他已经死了，一窝蜂地朝皇宫大门冲去，他们大声叫嚣着，威胁着禁卫军，禁卫军无可奈何，只好让他们进入皇宫。

根据普鲁塔克的说法，那时没有人认为他是中毒身亡，但五年后，有消息传出，他的母亲奥林匹亚丝杀死了许多人，并下令将艾欧拉斯（安提帕特的儿子）的灰烬随风飘扬，这就是凶手。有几个历史学家说，是亚里士多德给安提帕特出了一个计谋杀死国王，还给了他一种毒药。

随着这位曾经称霸过半个大陆的君王的陨落，关于他的流言也就不胫而走了。关于艾欧拉斯下毒的传闻迅速在雅典城中流传开来，著名的言辞家狄摩西尼建议投票给艾欧拉斯以感谢。一些流传至今的传说，由于缺少有力的证据，也许能证明亚历山大和赫菲斯蒂安的死亡并不是自然而然地发生的。一位马其顿人的官员，亲眼目睹了哈马丹和巴比伦上的一幕。当亚历山大从印度回来的时候，他担心自己会成为下一个清洗的对象，他向一个占卜师咨询，他应该做些什么呢？算命先生告诉他，不要害怕，赫菲斯蒂安和亚历山大都快死了。

赫菲斯蒂安在数日后去世，亚历山大在一年后也去世了，两个人都是因为喝了酒精而莫名其妙地死去的。也有人认为是亚里士多德自己做的，但普鲁塔克只是简单地解释道：“一开始，亚历山大陛下很欣赏亚里士多德，甚至比他的父亲还要尊敬他，但不就后，国王陛下开始对他起了疑心。但他从来没有真正伤害过他，只是失去了对他的尊重，显然，他们之间的关系已经越来越疏远了。”正如关于亚历山大的很多故事，谁也不知道事情的真实情况是什么。