癌症基因组如何改善儿童白血病的治疗?

极光欣色 2024-08-16 17:40:52

正常T细胞(人工染色)可被T细胞急性淋巴细胞白血病特征的异常免疫细胞排挤

一项基因组分析显示,一种主要影响儿童的侵袭性血癌有15种不同的亚型,每种亚型都与特定的结果和对药物的反应有关。这项工作为改善治疗带来了希望——例如,让一些儿童免于最严厉的化疗方案,而让另一些儿童接受最新的免疫疗法。

研究人员说,这种详细的分类为靶向治疗铺平了道路,为患有t细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)的人带来了希望,T-ALL约占所有儿科癌症的5%。今天发表在《自然》(Nature)杂志上的这项研究,可能有助于预测哪些人对治疗反应较弱,并可以指导医生从一开始就选择更有效的治疗方法。

比利时根特佛兰德生物技术研究所白血病遗传学研究员扬·库尔斯说:“这是一项了不起的研究,将为每个人提供非常丰富的资源……治疗T-ALL患者。”他没有参与这项研究。

一个干细胞坏了

当骨髓中的突变干细胞产生大量异常t细胞(一种免疫细胞)时,T-ALL就会发生。虽然T-ALL的生存率随着化疗的进步而提高,但15-20%的儿童和青少年经历了复发,或者有对标准治疗无效的疾病形式,研究报告的合著者、宾夕法尼亚州费城儿童医院的儿科肿瘤学家和研究员大卫·蒂奇说。他说,这意味着找到更好的生物标记物来预测哪些T-ALL患者需要靶向治疗或新的治疗方法是很重要的。

先前的研究已经确定了T-ALL的各种亚型,但没有一项研究的规模足够大,能够仅根据基因变化可靠地预测一个人的病程。因此,蒂奇和他的同事们分析了1300多名接受同样治疗的T-ALL患者的肿瘤细胞和健康细胞的整个DNA序列。研究人员还检查了细胞RNA,以了解癌症样本中的基因活性是如何改变的。

连接基因组和结果

分析发现了15种不同的T-ALL亚型,其中一些以前未被发现。每个亚型都表现出独特的遗传改变和基因表达模式。患有某些亚型的人在治疗后更有可能在体内留下癌细胞,这可能导致疾病复发。研究人员发现,拥有其他亚型的人更有可能在没有癌症的情况下存活下来,而一种亚型更有可能在身体的其他部位导致另一种类型的癌症。

分析还显示,与T-ALL相关的近60%的遗传变化发生在不产生蛋白质但会影响基因活性的DNA片段上。这些改变通常会导致基因的不适当激活,从而导致癌症的发展。

利用基因和临床数据,研究人员将T-ALL按照风险等级进行了分类:非常高、高、低和非常低。库尔斯说,这种分类可能有助于医生为高风险患者推荐更强的化疗或新的免疫疗法,为风险较低的患者推荐不那么激进的治疗。

这项研究吸引了来自美国、加拿大、澳大利亚、瑞士和新西兰的参与者。由于一个人的遗传背景会影响他们对治疗的反应,研究结果需要在不同的人群中得到验证,研究报告的合著者、田纳西州孟菲斯市圣裘德儿童研究医院的血液病学家查尔斯·穆利根说。

该研究还强调需要分析T-ALL患者肿瘤细胞的整个DNA序列。尽管由于成本原因,这种“全基因组测序”尚未普及,但Mullighan预计它将在未来变得更加普遍。“正是这样的研究有力地表明,我们应该越来越多地对这些类型的白血病进行全基因组测序。”

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极光欣色

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