1947年秋季攻势结束后,只担任2个多月8纵司令员被调离,原因是与上级顶牛了。这里的上级并非东总,而是冀察热辽军区首长。
1947年秋,8纵在成立之前是冀察热辽军区下辖地方主力,他先后担任热河军区、热辽军区司令员。
在1947年春之前,冀察热辽军区的前身是冀热辽军区,隶属于晋察冀军区关系。此后,因作战形势变化,察哈尔一部分区域并入到冀热辽军区,改为冀察热辽军区,程子华担任司令。1947年4月划归东北军区。
秋季攻势时,冀察热辽军区地方主力组建8纵、9纵,后来还组建11纵。虽然是野战纵队,名义上应该划归东野指挥,实际上根据形势需要,地域情况不同,依然由冀察热辽军区指挥,就像3纵、4纵长期归辽东军区指挥一样。
这位司令可没少与冀察热辽军区司令程子华顶牛。
在打隆化战斗时,久攻不克,程子华召集指挥员征求意见,让他亲自指挥攻击,看到战斗打成这样,他说这个指挥我干不了。对方也是命令的口气:干不了也得干!他说临阵换将,兵家大忌,而且采取添油战术。俩人因此还拍了桌子,最终服从命令。
部队编为8纵后,依然隶属于上下关系,在杨杖子战斗中,俩人的意见不同。一个认为啃不动敌人,不希望打,一个是将在外,君命有所不受。等于不听命令,没请示、没报告,最后仗打赢了。俩人在战后也没有交换意见,还未指挥过程孰是孰非争吵过。
相对于程子华来说,或许更喜欢中规中矩的部下,要听命令、好指挥,不要去冒险。但这位司令却是南辕北辙,对着来。秋季攻势后,程子华就要求把他换下,让段苏权担任。东总首长知道8纵在秋季攻势的表现不错,还得到嘉奖,总部首长希望留下他,但冀察热辽军区原本不隶属东北,如今都在一起打仗,还是要讲究团结,他被调离8纵。
冬季攻势时,他就没有在作战单位,而是养病去了,直到冬季攻势后1948年3月,接替洪学智担任6纵司令。6纵是一只老部队,尤其是16师和17师战斗强,上级希望这支部队还是要能打的指挥员来指挥。
6纵在辽沈战役中归萧劲光指挥的1兵团,参加长春战役,围困长春战役等。辽沈战役后,洪学智回6纵,他继续回8纵,段苏权在辽沈战役指挥有些问题,而被留在军区机关工作。
多年后,他在回忆与程子华的问题上,说到:打完秋季攻势,仗打得好,我骄傲了,跟程闹了别扭。这是他主动客观来说的,至于程有没有反思过这段不得而知。
在经过平津战役后,部队整编组建兵团,程子华担任13兵团司令,他担任副司令,南下作战俩人并没有发生太多事情。那时候他只是副司令,并不直接指挥部队作战。