1969年，上级调李德生从安徽调任到北京工作，担任总政部主任，跟着他一起入京的还有12军政治部主任李宝奇。

李德生调京工作，因率领12军在支左工作中表现突出，上级把他们的经验转发全国学习。这样的成绩，不仅仅是李德生，还有军、师干部的功劳。

李宝奇担任重建起来的总政部组织部部长，直接提拔为正军职。

1971年，上级让李德生兼任北京军区司令员，或许为加强军区领导， 李宝奇再次被调任，到北京军区政治部主任，成为兵团职干部。1973年12月，李德生调离北京后，他继续在军区工作，但在1975年不知道因何缘故改为上海警备区政委。

上海警备区隶属地方军区，与各省军级级别一样，是正军级单位。从级别来看，他从兵团职务改为正军职。与周少麟搭档。

周少麟过去担任南京军区炮兵司令员，属于正军职，后被派往上海警备区担任司令并兼任南京军区副司令员。

李宝奇在上海工作一年多，随着特殊时期结束，他恢复到兵团职务，担任南京军区政治部主任，又被提拔为军区副政委。

很多人不知道，他在担任12军政治部主任时，部队就隶属于南京军区，在京工作6年重返南京军区，也不算陌生。