甲状腺功能异常包括甲状腺功能亢进和甲状腺功能减退。对于任何无需进一步外科治疗的，排除恶性可能的，或者仅仅需要药物控制的甲状腺功能异常，航空人员体检鉴定主要关注其甲状腺功能控制情况。只要甲状腺功能获得满意控制的，通常均可合格。

各级体检合格证申请人甲状腺机能亢进症临床治愈后，可鉴定为合格。需用药物控制的甲状腺机能亢进症，无症状，无并发症，无药物不良反应，经治疗甲状腺功能指标正常后继续观察60日，连续2次（间隔21日）血清甲状腺素（T4）、游离甲状腺素（FT4）、三碘甲腺原氨酸（T3）和游离三碘甲腺原氨酸（FT3）在正常范围，可鉴定为合格。

各级体检合格证申请人患有甲状腺机能减退症，无症状，无并发症，无药物不良反应，血清促甲状腺素（TSH）和FT4水平正常，可鉴定为合格。

现阶段甲亢的治疗方式为药物治疗，碘131治疗和手术治疗，它们的主要目的都是降低已升高的甲状腺激素水平。抗甲状腺药物主要通过抑制甲状腺激素的合成治疗甲亢。单纯抗甲状腺药物治疗的治愈率仅40%，复发率高达50-60%。目前常用的药物有甲酰胺咪唑和丙硫氧噻吩。

甲减的标准治疗为每日使用合成甲状腺激素——左甲状腺素片。这种口服药物可以恢复足够的激素水平，逆转甲状腺功能减退的症状和体征，起效快，安全可靠。甲状腺激素治疗根据具体甲减病因可能是终身的，所需剂量会根据甲状腺功能复查结果进行调整。

这些甲状腺功能的治疗方法均是航空人员体检鉴定所允许的。

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