医药工业废水由于其高有机物浓度、有毒有害物质的存在以及复杂的成分，使得处理难度较大。此外，废水中还可能含有药物残留物，且水质会随着医药产品种类、原辅料和生产工艺的变化而发生变化。因此，采用传统的生化方法处理这类废水往往效果不佳，难以达到排放标准。

医药园区尤为突出，汇聚了众多医药生产企业，每家企业的工艺和产品都有所不同。因此，医药工业废水可分为发酵类制药废水、化学合成类制药废水、制剂类制药废水、中药类制药废水等。对于医药园区的废水处理，需要针对不同类型的废水进行分类预处理，特别是高浓度难降解有机废水、高氨氮废水、高盐废水、含抗生素废水等。

对于高浓度难降解有机废水，可采用化学处理法，如高级氧化、臭氧催化氧化、铁碳微电解、芬顿氧化、催化湿式氧化、焚烧、超临界氧化等。对于高氨氮废水，可选用物理化学法，如吹脱法、化学沉淀法等。某企业的高浓度废水通过两级吹脱法处理，成功将氨氮浓度从超过5000mg/L降低至低于500mg/L。对于高盐废水，一般采用蒸发结晶法，包括多效蒸发、热力蒸汽再压缩蒸发、机械式蒸汽再压缩蒸发以及降膜式机械蒸汽再压缩循环蒸发等。

经过预处理工艺后，医药园区废水进入综合废水处理阶段，通常采用生化处理法。

厌氧生物处理法和好氧生物处理法的组合已在工业废水治理中得到广泛应用。厌氧生物处理法包括上流式厌氧污泥床（UASB）、厌氧膨胀颗粒污泥床（EGSB）、厌氧内循环反应器（IC）、水解酸化法（HUSB）等。这些方法在有机负荷较高的情况下仍能发挥重要作用，去除大部分有机物并提高可生化性。同时，它们还能将复杂的有机化合物转化为简单化合物，并产生可回收利用的能源——甲烷。

好氧生物处理法包括生物接触氧化法、序批式间歇活性污泥法（SBR法）、活性污泥法、膜生物反应器（MBR法、MBBR法）等。通过好氧生物处理法，可进一步降解厌氧生物处理法未能处理的有机物，最终产物为二氧化碳和水，实现净化目的。

深度处理工艺旨在解决生化处理工艺无法达到排放标准的问题。常见的方法包括氧化法、混凝沉淀法、活性炭吸附法、膜分离技术等。通过深度处理工艺，可确保医药园区废水达到相关排放标准，保护环境和人类健康。