“我已决定，明天就去重庆面见老蒋！”在一众劝说声中，卢汉果断地说道。

1949年8月，“龙云策动云南正式起义”的消息，迅速传遍了全国各地。已经身在台湾的蒋介石听说此事后，凭借着远超常人的政治嗅觉，很快意识到这不过是为了耸人听闻，早在1945年，龙云和卢汉已经结怨，两人不可能如此配合默契。

为了确保云南不会发生变乱，蒋介石决定立即出面，亲自处理云南问题。匆匆赶回到重庆后，蒋介石立即召见卢汉到重庆面谈，并派俞济时亲自前往昆明，到卢公馆坐催卢汉上路。

至此，卢汉感到情况已经很严重。其实在此之前，卢汉已经派人和共产党有过接触，只是由于云南地处偏远，没有合适的时机起义。龙云在香港发表云南起义声明后，将卢汉推到了一个十分尴尬的境地，如今蒋介石召见，卢汉此去恐怕凶多吉少。

究竟去还是不去，必须立刻做决定。卢汉在给俞济时开完接风宴后，立即召集身边高参开会，结果大家争论了两个多小时，谁也没说服谁，又急又气的卢汉当即拍板：

“我这就去重庆，看看老蒋对我怎么个处置！”

为了以防不测，卢汉和众高参约定，万一自己被扣，云南立刻插起红旗，通电起义。

为了避免部下和亲友送行时的尴尬场面，卢汉悄悄提前登机飞往重庆，蒋介石得知卢汉抵达，特命张群去机场迎候。一见到卢汉，蒋介石满脸堆笑，连声说着“辛苦”，话里话外体现着对卢汉的器重，并表示将给卢汉拨发一百万银元，以确保云南安定，巩固西南后方。

在来重庆之前，卢汉已经做好了有来无回的准备，结果蒋介石如此慷慨大方，让卢汉恨不得立刻赶回昆明，在起义前建立起一支威武的雄壮之师。结果蒋介石话锋一转，说有些问题不能单凭武力解决，还拿出了一份近300人的名单，让卢汉回去“整肃”。

到了此刻，卢汉才算明白了蒋介石的真正用意，他就是要借自己的手，来屠杀中共党员和民主人士，彻底断了自己起义的道路。但毕竟卢汉是有备而来，片刻的慌乱之后，卢汉立刻冷静下来，还站起身来对蒋介石表了一番忠心：

“总裁放心，我绝对效忠党国和总裁，虽死不变！”

卢汉回到昆明之后，立即对名单上的人展开营救，派人通知他们赶快逃离昆明。正当卢汉忙于布置安排的时候，徐远举带着十几名特务抵达昆明的消息传来，卢汉这才意识到，自己在被蒋介石滞留昆明期间，已经开始为“整肃”做准备。

由于名单上前几个重要人物没有抓到，徐远举和沈醉商量之后，决定全城戒严，兵分几路开始搜捕。一夜之间，特务们手持搜捕令，让400多名中共地下党员、进步师生和民主人士全部戴上了手铐脚镣。

蒋介石得知云南“整肃”的情况后，很是高兴，他知道卢汉在国共之间的态度还摇摆不定，为了将卢汉拉上自己的“车”，蒋介石要让卢汉的双手沾满共产党人的鲜血，因此他给卢汉发去一封电报，只有短短的八个字：

“情有可原，罪无可逭。”

此时的卢汉已经决心站到人民的一边，可蒋介石的命令也是迫在眉睫，一旦被徐远举和沈醉知道，自己将再也无法从蒋介石的战车上脱身。正当卢汉为此苦恼之际，他突然想到了和自己一同策划起义的李根源。

李根源过去是云南讲武堂的创办人，也是朱德的老师。在蒋介石发动内战后，李根源多次呼吁停止内战，对蒋介石迫害同胞的举动更是不满。

于是，卢汉立刻派人把李根源请来，请他帮忙出主意拖延时间，以保全那些革命志士的性命。李根源手持电文，沉思了片刻后，提笔在电文上画了一个反钩，然后交给了卢汉。

“好！好！”卢汉看过之后，连连称赞李根源的智慧。小小的一个改动，虽然没有改任何一个字，却让蒋介石的意思完全变了。

卢汉知道这个办法只能拖延一时，在徐远举和沈醉提出处决名单后，卢汉表示为了慎重起见，要进行复查并组织军事法庭审判。经过一番错综复杂的斗争后，蒋介石终于同意了卢汉的要求。

在卢汉的安排下，审判长和主办军法官的大权牢牢掌握在他的手中，并且卢汉下令没有他本人的手令，任何人不得传讯、提审。在之后的半个月时间里，经卢汉批准，先后释放了300多名革命志士。

后来李宗仁到昆明视察，卢汉利用李宗仁和蒋介石的矛盾，请李宗仁从宽处理被捕的革命志士。而李宗仁此时深知国民党大势已去，为了给自己留条后路，在蒋介石原本的电文上又加了一句话：

“罪无可逭，情有可原，准予从宽处理。”

按照李宗仁的指示，卢汉下令将最后一批被捕人员释放。至此，“九九整肃”以最理想的方式解决，十二天之后，卢汉宣布云南和平起义，回到了人民的怀抱。