1949年10月10日，远在北京的粟裕收到了一封三野司令部转来的第十兵团作战方案，其中写道，第十兵团将于3天后，也就是10月3日发起“金厦战役”，具体布置为：以5个师的兵力进攻厦门，以2个团的兵力进攻大嶝小嶝，以28军182师进攻金门。整个作战方案的核心是“金厦并取”。
粟裕看到这份作战方案后，不由地皱起了眉头。经过一天的认真思索，他在第二天提笔写下了回电。粟裕提醒第十兵团，这个方案用于进攻金门的兵力太少，且“金厦并取”的方案表现出了轻敌情绪。他询问，用2个师的兵力进攻金门是否完全有把握？他希望兵团指挥员能认真分析敌军情况和我军的准备情况，要在有充分准备和把握的情况下再发起战斗。
他建议第十兵团，如果不是完全有把握，应该“首求攻歼厦门之敌”，如此“比较稳当，但有使金门之敌逃跑之最大坏处。究如何，请你们依实际情况自行决定之，总以充分准备有把握的发起战斗为宜。”
金门战役，是从1949年9月下旬开始准备的，到10月中旬正式发起。在这段时间里，粟裕并不在前线，当时正是新中国成立前后的盛典时期，粟裕奉命率领三野代表团出席了全国政协一次会议和开国大典，后来又参加了在京召开的军委军事会议。
在这期间，留在南京主持三野工作的，华东军区党委第三书记唐亮、代参谋长袁仲贤和副参谋长周骏鸣。关于金门战役的作战部署，是由第十兵团通过唐亮等人转报给在北京的陈毅、粟裕的。等粟裕忙完北京的工作回到南京，已经是10月23日。10月24日黄昏时分，28军就奉命对金门展开了进攻。
由于粟裕反对“金厦并取”的作战方案，第十兵团决定先攻厦门，再攻金门，原本定于10月13日发起的金门战役就被推迟到了10月下旬。
后来金门战役失利，有很大的一个原因就是，28军进攻的金门的时候，胡琏的2个师已经增援到了金门。是不是粟裕反对“金厦并取”的意见过于保守，导致延误了战机呢？其实不是的，据《粟裕传》记载，在10月9日的我军进攻大嶝、小嶝的时候，就遭遇了胡琏兵团的主力11师，并抓获了几名俘虏。经过审问，这些俘虏供称，胡琏兵团的2个师已经入驻金门。也就是说，即使在10月13日发起进攻，也显得有点迟了。但遗憾的是，这条重要的情报在当时没有得到足够的重视。
10月12日，我军得到准确情报，称胡琏兵团已经奉命增援金门和厦门。这一情报确实是事实，但又不全是事实，因为胡琏兵团是已经进入金门了，而不是才出发前往增援金门。因此，第十兵团的指挥员强调，我军应该抓住时机，抢在胡琏兵团的全部到达之前发起进攻。
粟裕在此前的回复电报中指出，“总以充分准备有把握的发起战斗为宜”，他尤其强调船只的准备情况。但由于这条情报的“干扰”，第十兵团决定抓住战机发起进攻。此时28军只收集到运输3个团兵力的船只，怎么办呢？指挥员认为，可以在将第一批3个团运输上岸后，将渡船调回，进行第二次兵力运输。
10月24日，战斗打响后，28军第一梯队的3个半团顺利登上金门。第十兵团随即向三野司令部报告，称预计在第二天晚间可以解决战斗。然而，后续事情的发展却出乎了他们的预料：第一梯队登陆后，所有船只因为落潮而搁浅，成了敌人的靶子，被迅速摧毁。这导致第二梯队无法登陆，不能按照原计划对第一梯队进行增援，只能无奈地隔海观战。第一梯队部队在孤立无援的情况下，与3个军的敌人血战两个昼夜……
10月27日，粟裕收到了第十兵团的战报，一天后，他在回复十兵团并上报中央的电报中，用了“甚为痛惜”四个字来表达自己的心情。在电报中，他直言不讳地指出：“（失利的）主要原因，为轻敌和急躁所致。”粟裕写道，最初你们决定金厦并取，用一个师的兵力进攻金门时，就有轻敌和急躁和表现。“当时我们曾电你们，应先集中力量，攻占厦门，尔后再转移兵力攻占金门，不可分散力量。但未引起你们的深刻注意，致有此失。”
粟裕电报发出一天后，毛主席将粟裕的电报转发各野战军前委和各大军区，并沉痛地写道：
“各级领导干部中，主要是军以上领导干部中，容易发生轻敌思想及急躁情绪，必须以金门岛事件引为深戒……务必力戒轻敌急躁，稳步地有计划地歼灭残敌，解放全国，是为至要。”
2个月后，毛主席在给筹备解放海南岛的四野发去电报，写道：
“渡海作战，完全与过去我军所有作战的经验不相同……三野叶飞兵团，于占领厦门后，不明上述情况，以三个半团九千人进攻金门岛上之敌三万人……你们必须研究这一教训……并望你向粟裕调查渡海作战的全部经验，以免重蹈金门覆辙。”
金门战役失利后，第十兵团召开扩大会议，总结此战失利的经验。叶飞代表兵团党委在会议上发言指出，此次失利，“应该由我们负主要责任”，华东局、三野前委指出的“轻敌、草率、急躁”，确实是此战失利的主要原因。叶飞主要谈了4点：
第一，在战前的战役指导思想上，我们就犯了轻视厦门的错误；
第二，在决定发起进攻前，胡琏兵团已经基本全部到达金门，我们没有更慎重地考虑，下令停止进攻；
第三，敌人的垂死挣扎的顽强性认识不足；
第四，在厦门战役中，我们已经发现渡船来回使用是困难的，不行的，但战后却没有认真研究，在金门战役中再次犯了这个错误。
面对十兵团同志坦诚深刻地检讨，粟裕和三野前委也主动向中央承担了责任，11月15日，粟裕在给毛主席的电报中写道：作战失利虽然是由于高级指挥员轻敌骄傲、急躁等毛病导致的，但我“未尽到检查与督导之责，亦不能辞其咎”。几天之后，粟裕在电报中再次主动揽责，称自己“未能及时予以指导与教育，亦应负其责咎”。
中央在给十兵团的电报中安慰了大家，称：金门战斗虽失利，但部队及作战行动极为英勇，望对部队多加鼓励。
