太平天国农民起义在南京留下的遗迹和重要文物有几多。以下是太平天国农民起义在南京留下的部分遗迹和重要文物：

遗迹

- 太平天国天王府遗址：位于南京市玄武区长江路292号，是太平天国的皇宫，现存遗迹有西花园、大殿、暖阁和穿堂等 。

- 瞻园：位于瞻园路128号，是太平天国东王府和幼西王府遗址 。

- 堂子街太平天国壁画遗址：位于堂子街108号，原是太平天国某王府所在，现被辟为南京太平天国壁画艺术博物馆，存有18幅壁画 。

- 天堡城和地堡城遗址：天堡城遗址在紫金山天文台处，地堡城位于太平门外龙脖子隘口附近，是太平军拱卫天京城的重要军事据点 。

- 天朝总圣库遗址：位于升州路338-360号，是太平天国存放财物的地方，后为英王陈玉成王府 。

文物

- 太平天国历史博物馆馆藏文物：位于瞻园的太平天国历史博物馆，馆藏太平天国文物2800余件，如团龙马褂、《钦定士阶条例》《钦定军次实录》《钦定英杰归真》原刻本等 。

- 洪秀全“纶音”碑碑额和碑座、石鼓等：在太平天国天王府西花园水池中、假山上曾有发现 。

- 太平天国石雕水池：现存于太平天国历史博物馆，原是东王府中的花盆 。以下是太平天国在南京相对保存较完整的遗迹：

- 太平天国天王府遗址：位于南京市玄武区长江路292号，现存遗迹有西花园、大殿、暖阁和穿堂等 。 

- 瞻园：位于瞻园路128号，曾是太平天国东王府和幼西王府遗址，现作为太平天国历史博物馆，建筑主体保存较好 。 

- 东坝太平天国军营垒遗址：位于高淳区东坝镇东北，是太平军的营垒遗址，保存基本完好 。