1932年秋，主政新疆的金树仁统治不稳，全疆板荡。哈密地区爆发了大规模农民起义，而南疆地区局势也岌岌可危。宗教极端组织、地方割据势力、帝国主义代言人以及不堪压榨的维吾尔等各族普通农民等各方势力都纷纷浮出水面，企图趁乱割据一方，谋求自身利益。
在1932年底或1933年间，南疆的墨玉、莎车、和田等地先后爆发了起义夺取了当地政权，各地领导者组成复杂，既有反抗封建压迫的底层农民代表，也有不少宗教极端势力以及大小军阀。其共同的目标之一是推翻金树仁所代表的的民国政府在当地的势力，但是其复杂的内部组成使得彼此间利益冲突完全对立，根本无法调和，相互间也是争斗不休。
南疆地区及叶城县地理位置
1933年4月间，和田伊斯兰教军的首领依米尔艾孜热提、 依米尔沙依甫、毛里维率领自己的军队来到莎车与当地民国政府势力作战。 但他们到了叶城县后，第一件事却是废除了艾伯都拉艾来木、依禅阿塔拉汗和加、 沙比尔汗和加等人成立的当地民众起义政权，建立了自己的政权，任命司马义大毛拉为县官，将被烧的县衙门大门重新装修后挂上了 “叶城县伊斯兰政府”牌子，留下了一部分军队，又征召了一部分当地青年人当兵，组成新部队，让这些当地维吾尔青年开往莎车与政府军作战送死。
这个伪政府在叶城倒行逆施，残酷霸道。他们派人到各寺院，把不做乃玛孜 （不做祈祷）的人集中在那里，用皮鞭抽打，并向他们收费。还到 农村收取各种苛捐杂税，无代价地索取马、牛，并搜查群众的家， 随意拿走从汉、回等其它族百姓家里得来的财物。他们认为有罪的人，即用绞刑、大头棒、大刀杀死。还把妇女关在笼子里吊起来，并用皮鞭抽打。
伊斯兰教军队进入时，有的骑马，有的骑驴，有的徒步，他们举着红、蓝各种颜色的旗帜，头上缠着各种颜 色的布，军队很不正规。走在军队前面的人还念着经。
这个所谓的伊斯兰政府毫无人性可言。举个例子，有一天从莎车押来了 3个人，都判了死刑。仅仅是因为他们用葫芦盛着水，爬过城墙下边的渠道给被围困在莎车汉城的汉人送了水。
莎车古城
那天中午，伊斯兰教士兵把其中一个人从衙门拉到牛街，叫他跪下后，十几个手持大头棒 的兵士把他团团围住，听到哨声后,就都抡着大头棒乱打，打死之后，还不停地在死尸上毒打。另一个人，是拉到大寺门前用刀砍死的。第三个头裁花帽，身穿白褂，腰缠花带的人，拉到绞架台上，脖子上套好绳扣后，一好像毛拉的人，对那人说：“你给被围困在莎车汉城的汉人送水，犯了大罪，所以宗教法庭判处你死刑。你要悔过，重新入教赎罪，这样你就可以上天堂。”那人因惧怕，吓得说不上来，毛拉又一句句地教他说，然而他一说完毛拉就毫不犹豫地把他绞死了。
司马义大毛拉当了县官后，用绞架、大刀、大头棒处死了一些人，又接着砍掉了 7个人的手，因为这几个进行偷盗，捕获后，司马义县官即命依力阿訇大毛拉按宗教法庭规定，砍掉了他 们的手，砍手前屠夫肉孜把他们的手用绳子绑起来，先割下大拇指，然后把手剁下来，为了不让手流血，又把手塞进油锅里转两下，然后牵着他们游街，并把剁下的指头和手，插在刀尖上，举着叫群众观看。这些被剁掉手的人，由于感染，整个肘臂化脓渐渐腐烂而死去。内中虽有二三人，经名医治疗，渐有好转，但不久也死去了。如鞋匠克其克阿洪，是在他哥哥铺子里学手艺，一 天，他哥哥不在家，他急需要钱用，就拿了他哥哥的4两银子，因而就把他定为小偷而把手剁掉。虽经名医治疗，也只活了两个月就死了。
实行伊斯兰教政权后，严禁12岁以上的姑娘和妇女上街，就是戴上面纱也不能出去。如果出去，就要被关在笼子里吊起来，用 皮鞭打。即使女儿回娘家和参加婚丧诸事，都要等到晚上才敢去，一时间全城萧条，人心惶惶。
好在不久局势生变，和田的起义军队与占领叶城的军队发生了大规模冲突，来自喀什的阿皮孜旅长率领部队乘虚而入，占据了叶城县。他的士兵大部分是北疆的吐鲁番等地人，纪律明显强于所谓的伊斯兰伪政府军。阿皮孜旅长在叶城县期间，取消了绞刑、杀人、剁人手以及把妇女关在笼子里吊打等刑罚.因此，叶城县一度出现了安定的生活局面。
但不久，阿皮孜旅长也奉命率部开拔，前往和田镇压当地的暴乱者。阿皮孜旅长走后，沙比尔汗和加用套筒枪和大头棒武装了 500人，重占县城。但没多久，和田方面的穆斯林士兵在城外打枪，接着叛乱者的先头部队，艾司海尔江率领着用钢枪武装起来的乌孜别克骑兵攻入县城，沙比尔汗和加的士兵扔下武器逃跑了.沙比尔汗和加也被俘虏，游街后被活埋了。在此期间艾司海尔江的士兵和伊斯兰教的士兵搜查了沙比尔汗和加的家，把家财抢劫一空。自称穆罕默德圣人第三十六代孙子的沙比尔汗和加，就这样惨遭杀害。
在新疆的国民政府军队
和田的穆斯林军队重新占领了叶城县之后，又开往喀什混战。总之，南疆各地当时大抵都是这样，各方势力混战成一团乱麻。城头变幻大王旗，不知今夕是何年。
在这一片乱纷纷中，突然出现了一个变数。那就是因夺权失利，从甘肃逃窜而来的回族军队，马仲英的三十六师来到了南疆。本地的各种宗教军队完全不是这支马家骑兵正规军的对手，1934年夏天，和田伊斯兰教部队司令依米尔沙依甫被马仲英的三十六师歼灭.住在叶城的部分部队又逃回和田。
大军阀马仲英
在和田与喀什之间的叶城县一时间成了马仲英、和田伊斯兰教军、本地宗教势力三方争夺的地方。今日这个来，明日那个来，这个来了那个跑了，就这样反复地在叶城县角逐。而不论哪一方临时占领叶城，都要强迫当地百姓大量贡献各种劳军供奉，人民因此困苦不堪。这种混乱局面直到1934年秋，和加尼牙孜阿吉势力和盛世才联合起来了，才告结束，马仲英的三十六师正式管辖了叶城县。当时，马仲英已去苏联，师长职务由马虎山代理，马的军衔是中将， 各旅旅长的军衔是少将。他们每个旅是一种颜色的马，分为白马、黑马.枣骝马、灰色马等.士兵大部分是回族人，汉族和维吾尔族很少。
他的白马旅部队在叶城住了几天之后，开往和田。攻占和田后，枪杀了很多参与和田伊斯兰伪政权的当地人（据说有几千人）。随后，马虎山也率领主力开赴和田去了.他走时在叶城留下了一批回、汉族人组成的游击队和一个骑兵旅，从此以后，艾伯都拉艾来木当了城防司令.叶城县驻扎着两千多士兵，他们每天上操，不参加任何生产，加重了当地民众的负担，每天需给他们供应粮、草、柴禾等项〔这均 系无偿的供应），农民们处在水深水热之中，为了生活，不得不放弃土地、果园、房屋，逃往莎车、麦盖提、泽普等县去谋生，因为莎车、麦盖提两县是在盛世才的管辖之下，泽普县处于中立区，这些县比马虎山管辖的县份要好一些。
除此之外，马虎山的部队把织布、裁剪、铁匠等手工业者，抓到部队去， 成立作坊，让他们纺线、织布、印染、做军服，铁工打马刀。 作坊周围还站有岗哨，不准他们出外和家属见面。不发工资，也没有休假日，直到1937年三十六师被歼灭为止，这些工人才回家与家人团聚。
1930年代的喀什风貌
1935年三十六师命令叶城县在县衙门东花园内成立一所县立学校，这学校在叶城县可以说是首次建立的新型学校，招收了 300名学生，用汉语和维语上课。维文课有语文语言、文学、宗教课，还有自然、算术、歌咏等，是以阿位伯识字课本为主.汉语上的国语。 学生一律穿绿色衣服，皮靴，挎着黑书包。又按照 三十六师的意旨，挑选个子一样高，年龄在13岁到15岁左右的 40名学生，经训练后准备派往印度去学习。但后来因为去印度的交通中断，才没有去成.学生到城外操场上操时，往返途中都是敲着鼓、吹着号。学生的伙食均由学校供给。
1930年的新疆银票
这时三十六师已经与盛世才正式撕破了脸开打了。盛世才毕竟财大气粗实力雄厚，稳步逼近叶城。恼羞成怒的马虎山于是也开始大开杀戒。一天，不知从哪里押来了 1? 名盛世才军队里东北籍俘虏士兵，马虎山任命的叶城县县官，回族人名叫阿吉的，把他们押到操场，排队跪好后，县官手持马刀，念完经后把他们一一砍死。
新疆王盛世才
这时盛世才为了迅速解决战乱，要求苏联出兵支援，苏联派遣了以政委马立克为首的俄罗斯士兵和柯尔克孜士兵到喀什等地.他们在飞机、坦克的配合下，如摧枯拉朽一般把三十六师和宗教势力阿不都尼牙孜的部队击溃并消灭。
在苏联部队的飞机、大炮、坦克的打击下，三十六师的士兵与阿不都尼牙孜的乌合之众纷纷逃回莎车、麦盖提、叶城等地。有几颗苏联飞机投下的炸弹落在县城渠道边，炸死了正在那里卖筐子、卖盐的22名男女老幼，酿成一场惨剧。但第二天又有一架飞机飞到叶城上空，扔下了很多传单，这些传单有两种文字，一种是维文的，一种是汉文的.给36师官兵看的。汉字的内容是：“三十六师的宫兵们，土匪马虎山抓你们来当兵，你们离开了父母妻子儿女，跟着他们，给他们卖命，死了是多么冤枉呀！你们放下武器投降后，我们可以送你们回原籍同父母妻子团聚……”另一份维文传单上内容则完全不同，是给当地维族百姓看的，上面写着：“我们的飞机昨天轰炸时，飞行员看错了且标，扔下炸弹，炸死了 22名无辜老百姓，我们对他们的家属表示歉意。我们对飞行员也已严厉惩罚了，绝不会再发生这样的事。。。”（是不是感觉苏联人还是比美国人善良些？起码美国人误炸平民后从来不会道歉）。
苏联红军
1937年秋，被苏联部队和盛世才的部队击溃的三十六师部队,溃逃到和田。他们在溃逃中，对农村的巴依，城镇中的商店 进行抢劫，特别是夜间抢劫得更凶，搞得鸡犬不宁，哭声不绝，枪声不断。白天从喀什方向飞来的十几架苏联飞机，沿着大路飞往和田， 对逃往和田、且末方向的三十六师士兵扫射和轰炸。马虎山打了败仗，穷途末路，只好带着他的姓白的参谋长与20多个人逃往印度去了。
在叶城县放下武器投降的马虎山士兵还有1000多人，他们把枪枝、大刀等交给县公安局，就流落在街头。第二天盛世才的部队就来了。当时来的部队中还有马立克指挥率领的一团苏联士兵和买吾拉诺夫团长率领的一团柯尔克孜士兵，并有12辆坦克。还有一位蔡团长率领着一团东北士兵。他们到了叶城之后，蔡团长和买吾拉诺夫团开往和田，叶城县只有马立克指挥的一团俄罗斯士兵留驻在县城.马立克指挥部设在城防司令院子内，为了稳固局势防止变乱，他指挥俄罗斯士兵将三十六师交了武器流落街头的1000多名士兵集中起来，于夜间集体带到格孜杂里克牙尔沙漠（即黑孜尔戈壁）集中枪杀了。至此，马虎山的三十六师全部被歼灭，盛世才正式统一了全疆。。。
