根据相关法律规定，上市公司应当遵循公平、公正、公开的原则，对于涉及重大利益的关联交易必须履行严格的内部审议程序，并对外进行充分的信息披露。这包括但不限于关联交易的对象、金额、交易内容等关键信息的披露，以保证所有投资者都能在平等基础上做出投资决策。

对于不动产抵押担保事项，同样需要按照相关法律法规进行内部审议，并及时向公众披露相关信息。这是因为不动产抵押担保可能涉及到公司资产的重大变动，对公司的财务状况和经营风险具有重要影响。

如果额尔敦羊业公司在2016-2021年间存在未履行相应审议程序的关联交易和不动产抵押担保事项，并未进行信息披露，这种行为违反了《公司法》、《证券法》以及中国证监会发布的各项规章制度。

内蒙古证监会出具警示函并将相关情况记入证券期货市场诚信档案，是对额尔敦羊业公司违规行为的处罚。警示函是监管机构发出的正式警告，要求公司改正违法违规行为，并在未来的业务活动中遵守相关法律法规。将违规行为记入诚信档案，则是对公司信用记录的负面影响，可能会对公司的融资能力、市场信誉等方面产生长远的不利影响。

额尔敦羊业公司应当认真对待监管部门的警示，采取有效措施整改相关问题，完善内部控制和合规管理体系，确保今后严格遵守相关法律法规，保护投资者权益，维护资本市场秩序。同时，公司还应当主动向投资者公开披露整改进展和结果，恢复投资者信心。