甄嬛入宫后没多久便得到皇上宠爱怀孕，怀孕三个月时因被华妃罚跪而小产。人人都以为，华妃和安陵容是真凶。岂不知，这一切的幕后黑手竟然是孩子的亲爹，也就是皇上。甄嬛也是事后听到温实初说的一句话才明白其中缘由。

1.皇上担心甄嬛母凭子贵成为华妃第二，不想让甄嬛上位太快。

甄嬛入宫没多久，凭借酷似纯元皇后的长相和过人的才智，很快赢得皇上青睐。皇上给予甄嬛很多专宠，甄嬛自然受到包括皇后、华妃在内的其他嫔妃的嫉妒。甄嬛曾多次明里暗里地向皇上投诉华妃，这让皇上怀疑甄嬛也有争宠之嫌。男人的本性让皇上忍不住宠爱甄嬛，但是君王的敏感又提醒她专宠一个人极有可能对皇位带来威胁，华妃就是很好的例子。

华妃的哥哥年羹尧是拥立皇上登基的功臣，皇上在很多事情上还需倚仗年羹尧，因此对华妃也是无限的专宠和包容。眼见着华妃的气焰已经快要盖过皇后，皇上却是无可奈何。除此之外，华妃还经常与年羹尧里应外合干预朝政，这些早已触碰皇上底线。皇帝自古多疑，华妃和年羹尧权势滔天，他时时都会有一种危机感。只是迫于形势他还不能拿华妃怎么样，但是心里早有所忌惮，他绝不允许有人成为第二个华妃。

哪怕皇上再宠爱甄嬛，与他的皇位比起来，甄嬛都是可以被舍弃的。何况只是用甄嬛腹中的一个胎儿来换取他皇位的稳固。君王自古多无情，牺牲一个孩子这样的事情，皇上当然做得出。

华妃宫中常年使用含有大量麝香的欢宜香。欢宜香中含马麝，药力是寻常麝香的十倍，只有西北的雪山才有，都是年羹尧进贡的。这些皇上自然最清楚，但他并未将此事告知甄嬛，甚至没有明确告知甄嬛不能到华妃宫中走动。明知麝香对甄嬛腹中胎儿有害却又不阻止，这就是皇上的高明之处。一旦甄嬛腹中胎儿受损，皇上完全可以将责任推到华妃那，既打压了华妃，又暂缓了甄嬛的晋升步伐，可谓一石二鸟。

2.皇上带皇后出宫小住，为华妃罚跪甄嬛直接导致流产找到合适时机。

皇上非常清楚甄嬛与华妃的关系不睦，也很了解华妃的为人，一旦帝后都不在宫中，华妃一人独大，必然会骑在那些她平时看不惯的嫔妃头上作威作福。但是皇上依旧为了祭祀这样本可不去的事情出宫数十日，将甄嬛这只怀孕的小羊送进华妃这只饿狼的口中。

作为一国之君，皇上自然有着超出常人的智慧和缜密的思维，他当然清楚他离开后甄嬛会面对一些什么样的状况。他也很清楚他其实可以留下一道保胎圣旨给甄嬛，晓谕六宫为保皇嗣周全，任何人不得以任何理由召见甄嬛。皇上甚至可以让甄嬛暂时到太后处小住，由太后代为照看甄嬛。

总而言之，只要他想保甄嬛腹中胎儿，办法有一万种，但他一种都没选，只是因为一切都是他有意而为之。他就是要借华妃之手除掉甄嬛腹中胎儿。之所以选择华妃，也是皇上深思熟虑过的。华妃的地位和她的为人，以及她对甄嬛的记恨，都决定了他在皇上看来是最合适的人选。

3.皇上命太医隐瞒甄嬛体内有麝香一事，眼看她受之毒害。

甄嬛怀孕后，一直为她请平安脉的太医都是宫中颇有资历的章太医。章太医年近六十，按照医者年岁越高经验越丰富的说法，章太医的医术自然在二十几岁的温实初之上。章太医经常为甄嬛请脉，却始终都没有发现甄嬛体内有麝香，而甄嬛小产后，温实初仅为甄嬛把了一次脉，便问甄嬛“娘娘，您用过麝香？”。足见章太医其实一直在隐瞒甄嬛体内有麝香的事实。

章太医早就发现甄嬛的真实病情，在甄嬛受麝香毒害已经出现头晕乏力等症状时，却依旧告知甄嬛只是心情郁结所致。恰巧当时淳常在刚离世，甄嬛确实有些伤心，便对章太医的话深信不疑。事关皇嗣，章太医敢明目张胆的撒谎，只有一种可能，那就是皇上已经提前做了交代。联想华妃不能怀孕却无太医敢说实情一事便知，皇上操纵太医已经是常事。

甄嬛小产后不久，章太医就向皇上请辞，是怕甄嬛有一天想明白小产的前因后果找自己的麻烦。皇上痛快应允。自然也是认为章太医离开后，便没有人知道甄嬛小产的真正原因，这件事就成为永久的秘密。