吴三桂反清的原因涉及到他个人的处境、家族的利益以及历史背景等多方面因素。尽管他选择与清朝合作，并在事业上取得了一定的成功，但最终他选择反清，这与他所面临的困境和他对国家和民族的忠诚有关。

首先，吴三桂作为明末将领，目睹了明朝的覆灭和清朝的崛起。在明朝灭亡后，清朝建立起了新的政权，但这对于吴三桂来说并不代表完全的胜利。他是明末抵抗清军的重要将领之一，曾多次参与抗清战斗，而他与明朝的关系使得他与清朝之间存在矛盾和冲突。对于他来说，清朝的统治意味着他作为明朝抗清将领的失败和背叛，这可能成为他选择反清的一个重要因素。

其次，吴三桂家族在明朝末年的政治斗争中扮演了重要角色。他的父亲吴克俭和兄长吴克宁都是明朝的重要将领，为了保护家族的利益和声誉，吴三桂可能感到有必要继续抵抗清朝的统治。此外，他的家族在西南地区有一定的势力和影响力，这使得他对地方政权和利益的维护具有重要意义。

此外，吴三桂与其他明末抗清将领的合作关系也对他的选择产生了影响。他与杨嗣昌、耿精忠等人都有合作过，共同抵抗清朝的入侵。这种合作关系建立了一种共同的目标和信念，即保卫明朝的遗产和民族的尊严。当他看到其他将领继续抵抗清朝，坚持追求明朝的复兴时，他可能也被这种信念所激励，决定与他们一起反抗清朝统治。

在清朝初年，西南地区出现了许多反清起义和抗争，形势相对复杂。在这样的历史背景下，吴三桂可能认为反清抗争仍然有一定的希望，他可以利用自己的地位和人脉资源来为抗清斗争做出贡献。此外，西南地区的地理环境复杂多样，山川险要，对于抵抗清军具有一定的优势条件。吴三桂可能认为，在这样的地理环境下，与其他抗清力量合作，他有机会在西南地区发起有效的反清斗争。

尽管吴三桂选择反清，但他并非一开始就持有这样的立场。最初，他选择与清朝合作，并被封为亲王，成为清朝的重要统治者之一。这一选择可能是出于他对自身利益和地方稳定的考虑。然而，随着时间的推移，吴三桂逐渐意识到清朝统治对于他和他的家族而言并非最佳选择。清朝对于他的地位和影响力有一定的限制，而他对于明朝的忠诚和对抗清朝的愿望逐渐加深。