曾国藩是一个比较能忍的人，对于湘军中的哥老会成员，他也是保持克制，一直忍着。

一方面他需要哥老会的人去冲锋杀敌，镇压太平天国，他内心的话说就是：「当下正是用人之际」，所以一切都跟着目前的局势来作出决定。

最让他对哥老会成员厌恶的是：这些人打仗的时候虽有勇猛之处，但在湘军内部发展哥老会的成员最不能忍，为此，他几次动了杀心，但还是忍了下来，只是发了一些军中的规矩「严究兵勇结盟拜会，结拜哥老会者斩。」

在清政府的眼里，哥老会和天地会一样，都是反清复明的组织，本来都要连根拔起，掘地三尺的清扫这些危害社稷的组织，时间到了咸丰年间，太平天国燎原一般在全国蔓延，如果不把哥老会的成员收编麾下，那意味着江湖上有多了一支反清的武装势力，所以，清朝对曾国藩的湘军里有哥老会的成员一般是睁一只眼闭一只眼，而曾国藩也是心知肚明朝廷的意思。后来，各种情报的汇集，证明了哥老会之前的来源虽然说不清道不明，但他们确实是天地会的一支。

“湘勇嗣后必见重于满政府，日后能有左中国之势力者，必为湘勇无疑”。

同样知道哥老会这支力量可以延续下去的是太平天国的李秀成，当太平天国大势已去，李秀成就秘密派遣过哥老会的成员集体投诚湘军，希望他们在湘军内部秘密结社，这一点李秀成是有远见的，他已经看到湘军已经成为强大的军事力量，而这样的力量是清廷忌惮的，所以一定会对这支力量动手的，到那个时候，能左右中国的势力必然是湘军，而湘军内部的哥老会成员将会形成一股强大的力量来改变现实，到那个时候，也许推翻清廷的目标就可以实现了。

1864年，也就是同治三年，曾国藩镇压太平天国彻底获得了全面胜利，接下来他开始裁撤湘军，让朝廷安心，这一下就裁掉了30万人，且并没有给任何的军饷，就地宣布这些人都不要了，以后该干什么也无人过问。

当时，很多人除了当兵吃军饷几乎什么都不会干，性格又比较懒惰，家里也没有田产，能活下去的办法就是大家结拜兄弟，成立山头，横行乡里，逐渐成为一个个活跃在民间的有生力量。这个时期，也正是哥老会成员发展最为迅速的一个时期，以前在军队里禁止大家加入哥老会，现在被裁了才发现，只有加入哥老会才有出路，有一口饭吃，哥老会很快就发展成一个庞大的社团。

曾国藩之后，左宗棠对哥老会也是伤透了脑筋。不得不说，哥老会是和中国军事力量接触最为「密切」的一个帮派，和其他的三合会、小刀会、青帮来说，他们大部分都是行走江湖，唯独哥老会，大部分成员都出身行伍，即使后来成为民间的帮会，其血液基因里也具有军人的因素，从曾国藩到辛亥革命再到抗日以及后来的内战，很多赫赫有名的将领最开始都曾是哥老会的成员。

据说左宗棠去往新疆平叛途中，队伍刚走到汉口就遇到了一件让他十分震撼的事情，他的军队忽然间就不听他的指挥，有十几公里长的队伍开始集结，好像队伍里有人在神秘的指挥，左宗棠大惊，忙问左右怎么回事，不一会儿军情上报过来，说哥老会的大龙头来汉口了，军队里的这帮人是要去欢迎他们组织的大佬呢！左宗棠听罢深为震惊，军队里有这样的事情，只怕日后不好带兵。这时幕僚建议让左宗棠做军队的大龙头，这样就能顺利出师新疆，左宗棠思虑再三，最后还是从了幕僚的意见，亲自当上了哥老会的「大龙头」，手下拥有了一批死忠粉。

只是让哥老会的人没有想到的是，左宗棠这个大龙头竟然是潜伏进他们队伍里的超级间谍，左宗棠靠着这个身份把哥老会的门派摸了个清清楚楚，在后来为朝廷剿灭哥老会的行动中有着丰富的经验，他有一个制胜的法宝，那就是找到哥老会帮会中的大龙头，灭了此人就等于蚁群没有了蚁后，帮派立刻做鸟兽散。而左宗棠对于裁军也不敢向曾国藩那样「冒失」了，他给每个兵丁都发了遣散费，让他们回家后足以能稳定的过一段时间来安排生活。

左宗棠之后，李鸿章、张之洞等清廷高管都有过和哥老会的「合作」，李鸿章的徽军，张之洞的湖北新军都曾招揽过哥老会成员，兴办团练，以求为日渐衰落的清廷提供兵源。

孙中山的时代，哥老会的作用愈发的明显，哥老会成为孙中山推翻清朝的重要一支力量，如辛亥革命的导火索保路运动就是由四川哥老会发动起来的。

为了革命需要，孙中山甚至一度也加入了洪门，洪门和哥老会源头是一家，都是从天地会开始发展的，不同的是洪门走出了国门，成为了「国际帮会」，一直到现在，洪门的子弟依然遍布全世界，尤其是以北美和南亚国家最多，而哥老会则以川人为多，蒋介石对他们是又爱又恨，并利诱他们发动过几次战斗，损失了哥老会绝大部分的力量。

蒋介石对哥老会的利用要远比对青帮的利用要残酷得多，青帮在蒋介石眼里不过是一些帮会组织，而哥老会则是拥有军事实力的帮会，想想都会让人彻夜不安。就连青帮的杜月笙对蒋介石也颇有微词，说他是卸磨杀驴，杜月笙的原话是：「青帮在政府眼中就是夜壶，须臾不得离之，方便完了就一脚踹进床下去。」

解放战争时期，哥老会经历过几次失败，国民党跑到台湾后，哥老会的中上层都被以反革命的名义打倒，逐渐退出民众的视线。