氧化类
杀菌机理是释放出新生态原子氧、氧化菌体中的活性基团；杀菌特点是作用快而强，能杀死所有微生物，包括细菌芽孢、病毒。以表面消毒为主，如二氧化氯、双氧水、臭氧、次氯酸钠等，该类消毒剂为灭菌剂。
醛类
杀菌机理是使蛋白变性或烷基化；杀菌特点是对细菌、芽孢、真菌、病毒均有效。但温度影响较大。如甲醛、戊二醛等。该类消毒剂可做灭菌剂使用。
酚类
杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或使酶系统失活；杀菌特点是对真菌和部分病毒有效。
醇类
杀菌机理是使蛋白变性，干扰代谢；杀菌特点是对细菌有效，对芽孢、真菌、病毒无效，如乙醇、异丙醇等。该类消毒剂为中效消毒剂，只能用于一般性消毒。
碱盐类
杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或溶解；杀菌特点是能杀死细菌繁殖体，能杀死细菌芽孢、病毒和一些难杀死的微生物。杀菌作用强，有强腐蚀性，如氢氧化钠、氧化钙、食盐（无腐蚀性）等。一般只能作为预防消毒液和灭菌洗涤液。
卤素类
杀菌机理是氧化菌体中的活性基因，与氨基结合使蛋白变性；特点是能杀死大部分微生物，以表面消毒为主，性质不稳定，杀菌效果受环境条件影响大，如次氯酸钠、优氯净等。该类消毒剂为中效消毒液，可以作为一般消毒剂使用。
表面活性剂类
杀菌机理是改变细胞膜透性，使细胞质外漏，妨碍呼吸或使蛋白酶变性；杀菌特点是能杀死细菌繁殖体，但对芽孢、真菌、病毒、结核病菌作用差。碱性、中性条件下效果好，如新洁尔灭、百毒杀等。该类消毒剂为中低效消毒剂，可以作为一般消毒剂使用。
