在上一期的文章中，小编主要给大家介绍了单细胞微生物基因组测序（Microbe-seq）。目前，要深入了解微生物群落中的菌株水平信息，依然面临着巨大的挑战。若能够成功解析微生物群落中的菌株水平的高质量基因组，这将极大地促进我们对微生物活动及其对宿主的影响的理解。

导语

为打破现有技术短板（a、宏基因组测序：分辨率低，组装质量差；b、基于培养的方法：只能解析极少数菌株，成本高；c、基于微孔板的单细胞测序：低通量，成本较高），元莘生物引入墨卓生物自主创新以微流控芯片技术和基因检测为核心的单细胞测序平台——MobiNova-M1。接下来，让我们跟随小编的步伐，一同领略墨卓单细胞测序平台的超强“输出”吧！

MobiNova-M1

MobiNova-M1实测数据展示

得益于该平台的技术优势，单细胞微生物基因组测序平台可满足多种不同类型微生物样本，包括粪便、唾液、水体、土壤、污泥等不同来源的微生物样本，并且单次实验检测到有效细胞数稳定>6000个，有效测序数据占比>50%。其中，临床肠道微生物项目占比最高，海洋项目为第二大样本类型。通量高，质量好，数据有效且稳定。

MobiNova-M1实测数据统计

不同来源微生物的样本统计

MobiMicrobe技术原理

技术路线

微生物与裂解试剂被包裹到液滴中；

微生物裂解释放出DNA；

在液滴中加入扩增试剂，进行单一微生物基因组扩增；

对扩增的DNA进行片段化处理；

在液滴中加入PCR试剂和带有DNA条形码的微球，进行PCR以标记基因组片段；

打破液滴、收集带有条形码的DNA片段。

技术路线示意图

项目周期

常见FAQ

Microbe-seq 可用于什么样本？答：Microbe-seq 可用于各种微生物样本，除了粪便样本以外，还可以检测包括口腔拭子、生殖道拭子、肠道内容物、土壤、活性污泥、水体滤膜、海洋沉积物等各类医学、农业、工业及环境微生物样本。

Microbe-seq 能测到多少细胞？测序量多少？答：一个反应的试剂盒至少可测到 6000 个细胞，150G 的数据量。如有需要，且样本量充足的情况下，可选择消耗多个反应试剂盒以达到更高的细胞数。

Microbe-seq 能组装出多少基因组？组装质量如何？答：组装基因组的数量和组装质量与样本类型、样本中微生物的多样性和组装方法等多种因素有关，我们不作保证。一般来说，测到的细胞数量越多，样本中微生物多样性越低，组装质量越好。这里给出一个参考依据，发表在 Science 上的 Microbe-seq 技术文章中，7 个样本共 21900 个细胞，总共组装出 52 个高质量基因组和 24 个中等质量基因组。