实验技术qPCR实验排雷指南:扩增曲线与溶解曲线异常,一次搞定!

啊研有话说 2024-12-04 14:02:02

排雷指南

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qPCR实验系列5 ————————»»»»

扩增曲线

&

溶解曲线

异常分析

做qPCR实验时

扩增曲线不稳定、溶解曲线杂峰······

这些“疑难杂症”是不是让你束手无策?

别慌!

今天,我们手把手教你

如何识别问题、找准原因

并附上精准的优化方案

助你快速搞定实验中的各种“拦路虎”!

扩增曲线异常

1. 扩增曲线不平滑

表现:曲线波动不平滑,背景信号不均。

原因:模板浓度过低或仪器波动导致信号不稳定。

优化方案:

提高模板浓度,重复实验。

检查并校准仪器性能。

2. 扩增曲线断裂或下滑

表现:扩增曲线未稳定提升,反而出现下降趋势。

原因:模板浓度过高或基线设置不当。

优化方案:

重新调整基线终点范围(如3-15改为3-10循环)。

重新分析数据,确认模板浓度适宜。

3. 个别扩增曲线骤降

表现:扩增过程中曲线突然下降。

原因:反应管内气泡破裂,信号采集失败。

优化方案:

提高模板浓度,重复实验。

检查并校准仪器性能。

4. 扩增曲线呈锯齿状且不连续

表现:曲线杂乱,重复性差。

原因:ROX添加不当,荧光信号校正失败。

优化方案:

‍‍‍‍‍‍确认ROX浓度和添加步骤是否正确。

重新调整反应体系,保证校正稳定。

5. 无扩增曲线或Ct值过大

表现:信号弱或完全无信号。

原因:热启动酶未充分激活,或模板浓度过低。

优化方案:

延长预变性时间至10分钟,激活热启动酶。

提高模板浓度或重新制备新模板。

6. 反应结束无扩增曲线

表现:扩增结束后无信号显示。

原因:循环数不足,或程序设置漏掉信号采集步骤。

优化方案:

增加循环数至40次,确保扩增充分。

检查程序设置,确认信号采集步骤无遗漏。

qPCR实验系列5 · 扩增曲线异常分析

溶解曲线异常

1. 杂峰在主峰之前

表现:主峰前出现低温小峰(约70-75℃)。

原因:引物浓度过高或退火温度不合适。

优化方案:

调低引物浓度,适当提高退火温度。

提高模板浓度,减少二聚体干扰。

2. 杂峰在主峰之后

表现:主峰后出现杂峰。

原因:引物特异性差或气溶胶污染。

优化方案:

提高退火温度,增强引物特异性。

定期更换实验耗材,避免污染。

3. 主峰为引物二聚体

表现:仅有引物二聚体,无目的基因主峰

原因:扩增片段过短(<80 bp),难以区分产物。

优化方案:

将扩增片段长度设置在100-200 bp,提高扩增效率。

检查引物设计,避免二聚体形成区域。

qPCR实验系列5 · 溶解曲线异常分析

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实验出问题并不可怕

重要的是找准原因、对症下药!

希望本篇内容可以为你的qPCR实验排忧解难

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