排雷指南
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qPCR实验系列5 ————————»»»»
扩增曲线
&
溶解曲线
异常分析
做qPCR实验时
扩增曲线不稳定、溶解曲线杂峰······
这些“疑难杂症”是不是让你束手无策?
别慌!
今天,我们手把手教你
如何识别问题、找准原因
并附上精准的优化方案
助你快速搞定实验中的各种“拦路虎”!
扩增曲线异常
1. 扩增曲线不平滑
表现:曲线波动不平滑,背景信号不均。
原因:模板浓度过低或仪器波动导致信号不稳定。
优化方案:
提高模板浓度,重复实验。
检查并校准仪器性能。
2. 扩增曲线断裂或下滑
表现:扩增曲线未稳定提升,反而出现下降趋势。
原因:模板浓度过高或基线设置不当。
优化方案:
重新调整基线终点范围(如3-15改为3-10循环)。
重新分析数据,确认模板浓度适宜。
3. 个别扩增曲线骤降
表现:扩增过程中曲线突然下降。
原因:反应管内气泡破裂,信号采集失败。
优化方案:
提高模板浓度,重复实验。
检查并校准仪器性能。
4. 扩增曲线呈锯齿状且不连续
表现:曲线杂乱,重复性差。
原因:ROX添加不当,荧光信号校正失败。
优化方案:
确认ROX浓度和添加步骤是否正确。
重新调整反应体系,保证校正稳定。
5. 无扩增曲线或Ct值过大
表现:信号弱或完全无信号。
原因:热启动酶未充分激活,或模板浓度过低。
优化方案:
延长预变性时间至10分钟,激活热启动酶。
提高模板浓度或重新制备新模板。
6. 反应结束无扩增曲线
表现:扩增结束后无信号显示。
原因:循环数不足,或程序设置漏掉信号采集步骤。
优化方案:
增加循环数至40次,确保扩增充分。检查程序设置,确认信号采集步骤无遗漏。
qPCR实验系列5 · 扩增曲线异常分析
溶解曲线异常
1. 杂峰在主峰之前
表现:主峰前出现低温小峰(约70-75℃)。
原因:引物浓度过高或退火温度不合适。
优化方案:
调低引物浓度,适当提高退火温度。
提高模板浓度,减少二聚体干扰。
2. 杂峰在主峰之后
表现:主峰后出现杂峰。
原因:引物特异性差或气溶胶污染。
优化方案:
提高退火温度,增强引物特异性。
定期更换实验耗材,避免污染。
3. 主峰为引物二聚体
表现:仅有引物二聚体,无目的基因主峰
原因:扩增片段过短(<80 bp),难以区分产物。
优化方案:
将扩增片段长度设置在100-200 bp,提高扩增效率。
检查引物设计,避免二聚体形成区域。
qPCR实验系列5 · 溶解曲线异常分析
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实验出问题并不可怕
重要的是找准原因、对症下药!
希望本篇内容可以为你的qPCR实验排忧解难
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