1949年，全军番号改编，原东野2纵改编为四野39军，刘震担任军长，吴法宪担任政委，吴信泉为副军长。

当部队南下中南时，部队接到上级指示组建兵团，刘震兼任14兵团副司令，吴法宪改为兵团副政委，而吴信泉调任政委。

在过去，政工将领改为军事主官屡见不鲜，负责军事工作的将领鲜有改为政治工作的，他算是四野中唯一从副军长担任军政委的将领。

实际上吴信泉可是军政双优的将领，在土地革命时期，他就是政工出身，担任过连指导员，师政治部主任；抗战时期，逐渐从纯政工转为军政双挑。从344旅团政治处主任提拔为团政委，旅政委，苏北军区分区司令兼政委。

抗战后挺进的东北，担任新四军3师独立旅旅长兼政委，组建2纵后，改为2纵6师师长兼政委。后被提拔为纵队副司令兼参谋长，协助刘震工作。

1949年部队改编南下后，他从副军长改为政委。从资历和能力上来说，是可以胜任的。他干政治工作长于干军事工作，对军的情况比较了解。

当衡宝战役结束后，刘震因身体不适，准备到后方休养。谁来接替军长的职务。他考虑再三，认为吴信泉合适。吴信泉自抗战开始就在这支部队，一直到1949年，看着部队的发展壮大，而且军事，政治工作都很拿手。

如果部队空降一个军长过来，想必不会在短时间内了解部队，可能会影响战斗进程。综合多方面考虑，吴信泉都是军长不二人选，因此向总部提出建议，由吴信泉担任。就这样，他成为四野军级中，唯一军政一肩挑的指挥员。

吴信泉的能力得到极大发挥，不过对于他来说，身兼军政职务压力不算很大，因为自己从抗战后期就一直这样过来的，军政一肩挑的好处是，作战方面工作可以一人决定，没有掣肘。因为军队实行军政双领导制，机关分工不同，但党委会可能决定一些事情。他既然是军政一把手，如何打，怎么打他说了算。一般情况下，除非各方面军能力很强的干部才后如此。

他率领39军一路祖国最南部的边陲重镇――镇南关。

新中国成立后，作为机动兵团的39军奉命抵达河南驻防，作为战略机动部队，哪里需要支援哪里。随着朝鲜战争爆发，39军成为第一批入朝作战的部队，吴信泉在朝鲜战场打得很出色，创志愿军一次战斗生擒美军人数最多的纪录。