1971年春，江青参观了碧云寺。在看到孙中山的水晶棺和孙中山用过的东西以及展览物品，已经生过气的江青，再次火冒三丈。

于是，江青命令万里，把孙中山的这些东西全部搬走。

想到北京没有合适放置孙中山这些东西的地方，万里感到十分为难，谨慎地问：“搬到哪儿去呢？”

听了万里的话，江青脱口而出：“送到南京中山陵去！”

对于这件事情，江青没有说过就忘，在回去后召开的中央政治局会议上，江青问北京市委书记吴德：“你们北京市委是共产党的市委还是国民党的市委？为什么碧云寺还展览孙中山的东西？我限你明天就搬走。”

对于江青的脾气，吴德是知道一些的。这是江青第二次提到这件事情了，如果硬顶着不办，肯定不好。

于是，在回去后，吴德便和万里商量了一下，决定先把这些东西搬走，找个地方存起来。

想到这件事情不利于党的统战工作，北京市委决定以内部装修为名，将碧云寺暂停开放。

事实上，此时的碧云寺，与南京中山陵建成后相比，孙中山用过的东西已经不多了。

1924年，在冯玉祥、段祺瑞和张作霖的邀请下，孙中山辗转来到北京，共商国是。此时，孙中山已经病了。

1925年3月12日，孙中山在北京铁狮子胡同行辕病逝，享年59岁。

孙中山去世后，国民党迅速成立了葬事筹备委员会，并遵照孙中山归葬南京紫金山的遗愿，开始着手筹备南京中山陵的建设。

然而，考虑到南京陵园的建设需要时间，治丧委员会为了确保遗体能够得到妥善安置，这才决定将孙中山的遗体暂厝于北京西山碧云寺。

3月30日，苏联政府赠予的、用来保存孙中山遗体的“水晶棺”，运抵北京。但是，经协和医院医生检验后，“认为质料脆薄，其外皮为金质，易于传热，不适于永久保持之用”。

最终，孙中山的遗体没能完好保存，使治丧工作留下了遗憾。

4月2日，孙中山的灵柩移厝至西山碧云寺，在这里一直存放了4年。

11月23日至次年1月4日，为了反共，以林森、邹鲁、谢持为首的部分国民党中央委员，在北京西山碧云寺孙中山灵前召开一届四中全会，也称西山会议。

此次参加会议的人，也被称为西山会议派。这些人长期与支持孙中山“联俄，联共，扶助农工”三大政策的国民党左派不合。在共产党内部，这些人也被称为国民党党内的右派势力。

1929年，孙中山的遗体由北京出发，移葬到南京紫金山南麓的中山陵，移灵时更换出的中山先生的衣帽，被放回原殓的楠木棺中，封入金刚宝座塔石塔内。

之后，为了纪念中山先生遗体暂厝之地，“国民政府”在普明妙觉殿，设立了“总理纪念堂”，并在金刚宝座塔石券门石塔设立了“总理衣冠冢”。

新中国成立以后，政府重修了碧云寺，并将这里复命名为“孙中山纪念堂”和“孙中山先生衣冠冢”，供后人瞻仰。

在中山纪念堂的正中，安放着孙中山的汉白玉全身塑像，在左右两边的墙壁上，镶嵌着用汉白玉雕刻而成的孙中山书写的《致苏联遗书》。此外，在纪念堂内还陈列着孙中山的遗墨、遗著。这便是江青所说的要北京市委“送到南京中山陵去”的物品。

2006年04月15日，在中共中央台办主任陈云林、副主任郑立中等人的陪同下，中国国民党荣誉主席连战一行来到碧云寺，参观了孙中山纪念堂，拜谒了孙中山的衣冠冢。

参观结束后，连战写下了“青山有幸伴中山　同志无由忘高志”，表达了对革命先辈孙中山的敬仰之情。