干细胞可以在人体内具有再生和修复功能，它可以替代和修复死亡和受损的细胞，从而增强人体的免疫和抵抗力，改善身体状况。干细胞在治疗许多疾病，如心脏病、糖尿病、关节炎等方面都具有特效性，能够修复受损伤的细胞，重塑组织器官结构，改善病患的生活质量。干细胞具有“趋化性”，即干细胞会“有目的”地迁移到相应的病灶或细胞损伤处，替代或修复死亡或受损伤的细胞，直接起到修复损伤组织的作用。
其次，干细胞拥有着极其强大的“旁分泌作用”，这种作用是指干细胞在周围的细胞间传递和调节信息，而分泌出各种机体所需的神经营养因子、抗凋亡因子等，如肝细胞生长因子（HGF），转化生长因子-β1（TGF-β1）、血小板衍生生长因子（PDGF）等，这些因子在不同的体内环境下发挥着各种不同的生物活性，对神经细胞、血管形成、骨修复、造血调控、神经营养等产生积极的影响，从而起到改善机体各个系统的机能的作用。
外源性干细胞能有效地刺激人体内原本就存在的自我修复机制，激活并唤醒那些处于休眠状态的干细胞，同时去抑制那些仍然在工作的干细胞的生长，使它们之间形成平衡。在这样的机制作用下，人体内的干细胞数量就会增加，让这些恢复原始状态的干细胞重新发挥出它们的功能，产生更多的细胞，从而使人体的各项机能得到恢复和改善。
在生物学领域中，干细胞是一种具有自我更新和多向分化能力的细胞类型，能够从单一细胞逐渐发育成一个完整的有机体，在医学和生物学的许多方面都具有广阔的应用前景。干细胞本身的性质使得它们能够应用于治疗许多方面的疾病，其中包括一些传统医学无法治愈的疾病。干细胞可以通过其免疫调控机制参与塑造和调控局部免疫微环境，在免疫紊乱性疾病中发挥重要作用。
此外，干细胞还可以促进细胞间的电能力、电传导的恢复，比如成体干细胞中有一种我们称之为间充质干细胞，其能分泌连接蛋白帮助细胞间连接、促进电离子通道的开放等，并已在很多疾病中得到应用。
