在房屋征收过程中，被征收人对评估报告的评估结果、评估程序等问题产生异议是常见的现象。针对评估报告有异议的，可以通过以下几种方式来维护自身合法权益。

一、公示期间要求修正

在分户初步评估结果公示期间，若被征收人对评估报告有疑问，出具报告的评估机构有义务作出解释说明与修正。

二、10日内申请复核

如果被征收人对评估结果有异议，可以从收到评估报告之日起10日内向评估机构申请复核评估。

三、向专家委员会申请鉴定

如果被征收人对评估机构作出的复核仍有异议，应在收到复核回复函之日起10日内，向被征收房屋所在地评估专家委员会申请鉴定。

四、复议或诉讼

如果经过复核和专家鉴定，被征收人对房屋价值的评估仍有异议，被征收人可以针对该补偿决定申请行政复议，也可以提起行政诉讼。

当评估机构出具的评估报告中有明显与事实不符或存在违法之处时，应及时提出异议。通过修正、复核、申请鉴定、协商订立协议、复议或诉讼的步骤，来维护自己的合法权益。