死刑犯浅仓将钉子吞进肚子中，狱警从监控器发现后，立刻将他送往医院。另一边浅仓的刑警好友从睡梦中惊醒，小薰梦见浅仓被处刑，吓得他没了睡意，女友也起来安慰他。
浅仓做完手术醒来，看见一旁的狱警在打瞌睡，悄悄走到狱警身边。没多久小薰就接到电话，正是浅仓打来的，浅仓在电话里表示要见小薰的搭档杉下。
浅仓逃跑的事情已经惊动警方，大量警察在医院里搜寻浅仓。小薰和女友也赶到医院，到达和浅仓约定的地点，小薰瞒着警方，想先听听好友要说什么。尽管如此，小薰还是对好友的所作所为感到生气，一见面就抓住对方的衣领。浅仓赶忙指着渗血的伤口，表明自己还是个病人，小薰这才冷静下来。
小薰和搭档之前是从其他部门被调到特命系的，特命系相当于是坐冷板凳，是不被上级重视的部门，也只有小薰和杉下两人。由于上级决定解散特命系，特命系小薰被调往驾照考场，而有能力的杉下则被调回警视厅。杉下不满上级随意调动自己，迟迟没有去警视厅复命，请假去了英国旅行。
杉下不在国内，小薰催促浅仓有事就说给他听，自己会如实传达给杉下，让浅仓说完就赶紧回去。浅仓开玩笑让好友带他离开医院，见小薰生气，浅仓便收起笑容，开始说正事。
浅仓想抓住一个叫小暮瞳的女人，罪名是杀人。浅仓很确信，在平城十年东亚医科大学发生的教授被毒杀的案件，就是这个女人所为，虽然这宗案子是一个迷案，至今也没有找到证据。但小暮瞳有着和浅仓一样的杀人气味，这种气味只有同样为杀人狂的浅仓能够闻到。在浅仓还是检察官时，就调查过此事，也和小暮瞳打过交道，当时浅仓就很确定是小暮瞳杀了自己的老师，奈何没有证据。浅仓相信如果是杉下，一定能够找到证据破解此案。说完警方的人也找到此地，将浅仓抓了回去，临走前浅仓一再嘱咐让小薰带话给搭档。
小薰不停的给在英国的杉下打电话，却忘了英国和日本是有时差的，连续好几天小薰都在英国的深夜和大清早打电话，这也引来了杉下屋对面的老太婆的不满。当杉下终于回到租房时，老太婆就喋喋不休的一顿骂，说是有个傻子连续不断的打来电话，没有一点常识。
当时那个年代是没有留言或电话记录的，但听完老太婆说的，杉下也很快明白是谁在给他打电话，在他认识的人中也只有小薰会做这种事，便很快给小薰回拨过去。小薰听完搭档的话，认为杉下是在讽刺他，虽然表面对他恭敬，心里却瞧不起。好友浅仓也只找杉下，小薰的孩子脾气顿时就上来了，没有和杉下说打电话的理由，只是寒暄几句就把电话挂断。
女友见状也毫不客气的让小薰先把孩子脾气收一收，要以正事为重，催促小薰重拨电话回去。小薰只好再给搭档拨去电话，可杉下挂断电话后就又出门了，小薰只能自己先进行调查。小薰利用职务之便，拿到了小暮瞳的驾照资料，只知道她目前还在上学，是个研究生。
资料实在太少，小薰找到认识的律师帮忙，看如何能和浅仓取得联系，因为当时的死刑犯只能和亲属见面。武藤提议小薰去上诉告好友，以袭击并抢劫狱警手机为由，之后武藤去做浅仓的辩护律师，如此一来，她就可以作为中间人传达信息。
浅仓告诉武藤，被小暮瞳杀害的是中药科学室的丸山教授，第一目击者是死者的助手，屋里没有可疑的地方，遗体也丝毫未受损，甚至解剖结果没有发现可疑之处。因此法医做了药物检查，确认死者服用了阿托品，是一种茄科植物所含有的毒素，是大学里的人可以轻易获得的毒药。遗体上没有注射过的痕迹，也没有检查到安眠药的成分，而教授经常服用营养剂，估计是有人把投毒的胶囊放到了营养剂中。警方调查死者周围可能存在的嫌疑人，但一直没有找到线索，因此成了迷案。
小薰跟踪小暮瞳到学校，却看见杉下的身影，杉下询问小暮瞳去植物园的路怎么走，还以没有方向感为由让小暮瞳带他去。在路上杉下和对方闲聊十年前发生的教授被杀事件，杉下说自己是一个推理狂，拜托小暮瞳带他找含有阿托品成分的植物，小暮瞳便直接带着杉下去看一个叫颠茄的植物。颠茄又被称为美丽的淑女，但美丽的花都是有毒的，但颠茄既能成为毒药也能是药物。
杉下推测凶手是一名女性，只有女人才会选择颠茄作为毒药。因为颠茄属名为Atropo，据说是来源于宙斯三个女儿之一的Atropos，Atropos是切断生命之线的命运女神。小暮瞳听完后敷衍了两句，便立刻告辞离开了，不知道是不是做贼心虚。
杉下看了一会颠茄，然后也跟着离开植物园，小薰一直等在植物园门外，看到杉下便大声喊他，把杉下吓了一大跳。原来是小薰的女友给杉下写了一封邮件，把情况告诉他，杉下才赶回国内，一下飞机杉下就去见了小暮瞳，刑警的直觉让杉下觉得小暮瞳确实有很大嫌疑。不只是美丽的花有毒，美丽的女性也一样。
小薰的女友是一名记者，在跟踪偷拍小暮瞳时，见到她和一个有些年龄的男人一起在商店购买衣服。以女人的直觉，女友认为小暮瞳和男子关系一定不简单，可小薰却认为他们也有可能是关系很好的父女。女友见小薰的态度，显然是对她私自发邮件给杉下的事情生气，便向小薰道歉。可小薰表示自己不是气女友发邮件的事情，而是邮件的内容，明显女友也认为他是个傻瓜。女友则认为小薰应该感谢她让杉下回到国内，推了男友一把后也生气的离开，小薰见状立刻表示自己原谅女友了。
杉下虽然回到国内，但还是没去警视厅复命，也就有很多时间可以调查案子。杉下托人调查到和小暮瞳在一起的中年男子是叫真锅的专务董事，杉下带着小薰一起去公司找他，以小暮瞳的名义，真锅一定会答应见面。虽然真锅有点不高兴，但见对方是警察，也就答应接受问话。
真锅声称和小暮瞳是朋友关系，两人是在一个舞会认识，还没说完，真锅就接到电话离开了，没过多久真锅没站稳，滚落到楼梯晕了过去，杉下两人跟着一起坐救护车去医院。在真锅的衣服里，杉下找到一个药盒，推测是阿托品中毒，便让医生尽快联系医院对此作出应对方案。可是还没到医院，真锅就停止了呼吸，经过医生的抢救真锅还是去世了。
医生检测后确定真锅是阿托品中毒而亡，真锅和丸山教授死法一样，并且都和小暮瞳有关系，小薰认为小暮瞳是专门以老头子为目标的“老头子杀手”，杉下对此不置可否。
杉下两人在小暮瞳家门口蹲守，小暮瞳回到家，两人便直接上前表明身份，还告诉她真锅出事了，可小暮瞳没有漏出一丝惊讶的表情。小暮瞳假装不认识真锅，小薰便直接掏出两人逛街的照片，见事情被拆穿，小暮瞳只好请两人进屋子谈话。小暮瞳承认和真锅交往了半年左右，还很诚实的表示两人是外遇关系，小暮瞳在一个由七日会组织的舞会兼职招待员，而真锅是七日会的会员，两人就是这样认识的。
母亲很早就去世了，家里只有小暮瞳和父亲住在一起，父亲是个植物学家，因为工作关系常常出国，小暮瞳说昨天父亲又出门了，所以基本上只有小暮瞳一人住在大房子里。小薰开玩笑要是小暮瞳父亲知道女儿和别人搞外遇，父亲是会哭的，小暮瞳便笑着说：你可别跟他说哦。
小暮瞳问真锅是什么时候死的，小薰回答是午后在公司，接着便要去给两人倒茶。杉下提出想参观一下庭院，小暮瞳就领着一起去了，杉下蹲在庭院看着其中一个植物，正是在大学里看到过的颠茄。
杉下询问小暮瞳难道不好奇，真锅是怎么死的，因为之前她只问了真锅是什么时候死亡。小暮瞳也不慌，淡定的询问死亡原因，杉下指着颠茄，表示是中阿托品的毒而死，杉下还当面指出，真锅和丸山教授的死亡手法一样，都是有人把毒药混在营养剂里，而今天死亡女神终于对真锅展开了笑颜。小暮瞳淡淡的说出：所以呢？
杉下两人没有证据，没办法和小暮瞳对峙，只好先行离开。杉下一直对家中没有母亲的照片感到很奇怪，就算小暮瞳母亲去世了，正常来说也会放一张母亲的照片留念。
杉下翻看七日会的会员名簿bù，里面都是一些大人物，杉下还从中看见熟人小野田的名字。但七日会有500多位会员，小野田不可能都认识，对真锅更是没有印象。于是小薰把照片给他看，小野田似乎见过小暮瞳，但不确定，毕竟舞会的招待员经常更换。说完小野田就准备离开，去参加七日会其中一个成员佐川的葬礼。
佐川在公寓被发现已经死亡三个月，因为公寓是佐川秘密租下的，没有人知道，租下公寓极有可能是有了外遇对象。起先他的家人还报了失踪案，没想到佐川早就离世，因为尸体严重腐烂，死者可能是自杀，法医就做了安眠药和常规药检测，目前还没确定具体死因。杉下翻看公寓现场的照片，看见一个药盒，工作人员表示里面都是一些营养剂，这也是三起案子的共同点，很有可能是小暮瞳所为。
小暮瞳也参加了佐川的葬礼，小野田故意等在门口，见小暮瞳出来，立刻迎上去表示要送她回家，实则是想打探小暮瞳的信息。小暮瞳表示和佐川不熟，只是吃过几次饭，听完小野田反倒有点吃醋，之前他约小暮瞳吃饭，却被拒绝了。随后小野田提到真锅也去世了，小暮瞳没有多大反应，紧接着小野田再次约她吃饭，但小暮瞳不想答应，回答考虑一下后，便让司机提前停车，两人就此道别。
随后小野田便约了杉下，将事情告诉他，之前小野田不承认认识小暮瞳，是担心会被怀疑。小野田认为，小暮瞳和佐川的关系一定不简单，也很难相信在她温柔的外表下，竟是一个杀人狂。小野田还嘱咐杉下，小暮瞳肯定没那么容易认罪。
杉下和小薰两人再次到小暮瞳家中做客，小薰直接了当的戳穿小暮瞳和佐川交往过，并且和她交往的两个男人都死了，小暮瞳听后满不在乎的说那又怎样，一边自然的给两人准备茶具。杉下和小薰看着手里的茶犹豫了一下，小暮瞳看出了两人的担忧，表示茶里没毒。杉下便直接喝了一口，小薰看没事才敢跟着喝起来。
小暮瞳提起听说佐川是病死的，杉下解释当警方不确定案件是事故，还是其他死因的时候，一般都会当成急性心力衰竭处理。小薰又补充和小暮瞳关系亲密的三人都已经死了，且有两人确认是阿托品中毒而死，很难不怀疑是小暮瞳所为。
小暮瞳仍然不慌，断定两人没有证据。但小暮瞳和杉下第一次见面时，其实就已经坦白了自己的罪行，当杉下想看含有阿托品成分的植物时，明明有很多植物都含有这个成分，小暮瞳却直接带着杉下去看颠茄，说明小暮瞳很清楚是什么毒药害死了教授。
原以为小暮瞳会继续狡辩，没想到她竟直接认输，还承认三起案子都是她做的。小暮瞳想在离开前换件衣服，小薰和杉下虽对她如此痛快的坦然罪行感到意外，但也没想太多。直到等待的时间有点久，杉下才发觉出不对劲，前去卧室敲门，见一直没人回应，小薰撞开门，发现小暮瞳倒在浴室里。经过医院的洗胃，小暮瞳没有生命危险，医生判断她是服用了控制神经系统的药物。
虽然杉下和小薰同为警察，但他们并没有调查案件的权限，两人被上级领导批评了一顿，临走前，领导还故意嘲讽杉下疏忽大意，竟让疑犯有机会自杀。
小暮瞳醒来后，搜查一课的人前来进行问询，原以为小暮瞳已经承认罪行，只要简单做个笔录就行，没想到小暮瞳竟推翻之前的说辞，还控诉杉下和小薰威胁要逮捕她，小暮瞳表示自己什么都没干，只是不想被抓，一时间不知该怎么办才服毒自杀。
但杉下的为人警局都是知道的，自然不会相信小暮瞳的说法，况且小暮瞳服用的毒药需要半个小时以上才会生效，显然她并不打算真的自杀。如今也没有证据可以证明小暮瞳就是凶手，警方对她也是无可奈何。
上级领导担心小暮瞳被逼服毒自杀的事情会传到媒体耳中，到时媒体就会大肆宣传警察粗暴，随意调查，被非难的就是他们刑事部了，领导便把事情报告给警视厅监察组，让其对杉下和小薰做出处分，严重的话还可能丢失警察这份工作。
正式处分还没下来，但杉下和小薰已经被暂停职务，两人本应安分下来，可这并不符合杉下的脾气。两人以道歉的名义带着金盏花前去大学看望小暮瞳，可金盏花的花语是惩恶，杉下装傻表示自己并不知道有这个花语，显然这是杉下对她的一个小小回击，小暮瞳到洗手间直接把花给扔了。
小暮瞳的妈妈是平成七年去世，那时她还只是个高中生，据附近的邻居说一家三口看着很和睦，丈夫非常爱他的妻子。如果关系这么好的话，为何屋子里没有一张妻子的照片。杉下和小薰在经常光顾的小餐馆里谈论此事，正巧被老板娘听见，老板娘脱口而出：她是不是在嫉妒啊？她非常喜欢爸爸，因为父母关系很好，她也许吃醋呢。老板娘的话给他们提供了一个新的思路，从小暮瞳交往的都是上了年纪的男人来看，小暮瞳是有“恋父”情节。
小暮瞳约了小野田一起吃饭，实则是想用小野田的官职去打压杉下，小野田毫不犹豫的答应会惩罚杉下，让他流放到孤岛。小暮瞳没想到的是，他和杉下两人也算是朋友，至于是去什么孤岛，对杉下来说肯定不是坏事。
上次送花时，杉下就说会是最后一次找小暮瞳，结果又来到家门口，小暮瞳虽然不高兴，但也没说什么。杉下表示上次花送得不好，感到很失礼，所以这次特意带来蛋糕向小暮瞳道歉。
有句话说：伸手不打笑脸人，开口不骂送礼人。虽然小暮瞳知道上次送花是有意的，但还是将两人请进了屋里。小暮瞳提出要去换衣服，说起换衣服小薰都有了阴影，小暮瞳便说不会再去自杀的，转身便回房间，拿起电话报警。
小薰看着房间里父亲的照片，和死者真锅真是有些相似，两人都是皮肤黑黑的，给人很精神的感觉，更确定了小暮瞳是有恋父情结。小薰还不忘调侃道，如果是这种类型的话，小野田是完全没机会了。
小暮瞳回到客厅后，杉下直截了当的表示刚刚去了小暮瞳母亲的墓地看过，发现很久没人打理。还提起家里没有一张母亲的照片，但小暮瞳明显不想提起关于母亲的事，突然门铃响起，就像救命稻草似的，小暮瞳立刻前去开门，是搜查一课的人接到电话赶来，小暮瞳声称杉下两人非法入侵。
小薰拜托同事调查，在平成十年小暮瞳的父亲从巴西回国，之后就没有任何记录，可小暮瞳之前是说父亲出国了。而杉下也查到奇怪的地方，小暮瞳父亲平成十年请假去巴西后，就一直没回单位工作，小暮瞳的说辞是，父亲正在享受私人旅行，单位便按辞职处理了。
教授也是在平成十年被害的，两件事一定有某种联系。父亲明明已经回国，可小暮瞳却对此隐瞒，那么小暮瞳的父亲此刻又在哪里呢？
小暮瞳的父亲回到家，两人寒暄了一会，小暮瞳就去冰箱为父亲拿饮料，转身回到客厅却不见父亲的踪影。原来这只是一场梦，小暮瞳想去拉上客厅的窗帘，却看见杉下和小薰站在窗外，两人按门铃一直不见有人开门，就绕到窗户边等着小暮瞳醒来。
小暮瞳不想搭理两人，转身就想走，被小薰拦住。杉下再次表示要道歉，可小暮瞳已经不相信这种话，杉下继续说道，已经知道真凶就是小暮瞳的父亲。谁是真凶小暮瞳是最清楚不过的，自然是不会相信，为了方便说话，小暮瞳把两人请进屋里。
虽然死去的三人都和小暮瞳有联系，但一直找不到她这么做的动机，于是杉下从另一个角度去思考，是否有人想把小暮瞳的外遇对象都杀死？有这种动机的人只可能是小暮瞳的父亲，唯一的女儿，竟然在被和自己同龄的有妇之夫玩弄，身为父亲当然会勃然大怒。
更何况父亲失踪没多久丸山教授就死了，而小暮瞳一定知道是父亲干的，所以才没有请求搜查，包庇父亲的罪行。为了不让杉下察觉出父亲失踪，还谎称父亲在周游世界各国。小暮瞳不想别人对自己的父亲胡说八道，一直否认杉下的推理，但杉下坚持认为自己的推理没有错。两人争执下，小暮瞳激动的说出：爸爸根本就不能杀人。而这正是杉下想要的答案。
小暮瞳从外面回到家，看见客厅里放着父亲的手提箱，立刻在家中寻找父亲，书房里电脑和书本都是打开的状态，仿佛父亲刚刚还在家中一般。虽然不可置信，但小暮瞳还是不停在家中寻找，终于在阳台发现父亲，小暮瞳立刻来到一楼，可父亲又消失不见了。
小暮瞳还是恢复了一点理智，在洗手间给自己洗了把脸，可父亲突然在身后出现，让小暮瞳更分不清现实还是梦中。这时电话铃声响起，是父亲打来的电话，小暮瞳立刻开车赶往一座偏僻的房子，拿出钥匙打开地下室的门，见到了他的父亲。杉下和小薰一直跟在身后，同样找到了地下室，而椅子上坐着的是早已干黑的尸体。
小暮瞳以为是小薰模仿父亲的声音引她过来，但小薰极力否认是他打的电话，或许父亲冥冥之中也希望女儿能够收手。
母亲死后，只剩下小暮瞳和父亲两人，小暮瞳再也抑制不住对父亲的爱意，便和父亲表白，但父亲实在无法接受女儿的心意，开始躲着她。小暮瞳对此感到很难过，为了让父亲永远陪在身边，小暮瞳骗父亲服下毒药，这样父亲就永远属于她一个人。而之前毒杀的三个男人，是因为他们都不是父亲，也无法替代父亲在她心中的位置，小暮瞳才将他们一一杀害。果然变态的想法都很变态，就因为这样的理由杀人，不喜欢分手不就好了。
杉下将父亲随身携带的一家三口的照片，拿给小暮瞳，小暮瞳才终于留下泪水，只是不知道这泪水里是否有悔恨。
本以为杉下和小薰会被免职，却没想竟重回到了特命系，而这都是小野田的安排，小野田表示，与其让两人免职，不如将他们流放到孤岛，也就是警视厅的特命系。虽然不知道小野田的葫芦里卖着什么药，但杉下并不在乎，能回到特命系才是他最开心的事。
