上回说到乾隆五十三年（1788年）清军一征廓尔喀军事行动草草结束，乾隆为此处理了一大批作战不利的官员，并时刻想着怎么把大清帝国丢掉的面子再找回来。就在乾隆郁郁寡欢的时候，廓尔喀人出招了。乾隆五十五年（1790年）十月，廓尔喀国王派人到拉萨索要300锭元宝（因为上次廓尔喀人入侵，西藏地方官员为息事宁人，私下答应每年给廓尔喀300锭元宝，以换取廓尔喀退兵），新任驻藏大臣普福认为廓尔喀人有病，居然提出这样“无厘头”的要求，想都没想就拒绝了廓尔喀人索要元宝的要求。

廓尔喀使者在普福那里“吃了瘪”，廓尔喀实际掌权人、摄政王巴哈都尔·沙阿非常愤怒，于乾隆五十六年（1791年）七月，再次发动对西藏的侵略战争。

廓军兵分两路，一路由达莫达尔·潘德率领，自济咙进攻宗喀；一路由阿比曼·辛格率领，从聂拉木进攻定日（在今定日县西）；另有一路绕过定日，经萨迦直趋日喀则。八月三日，廓军攻占定日、济咙。八月十六日，廓军攻陷萨迦。

廓尔喀再次入侵的消息传到北京，乾隆发飙了，发誓这一会非要“整死”廓尔喀不可。乾隆五十六年（1791年）九月二十五日，乾隆以清军名将福康安为清军总指挥，赴西藏主持军务，受命节制西藏所有兵马。乾隆还下诏索伦悍将海兰察、台斐英阿等为参赞大臣，统率1500名骁勇善战的索伦兵参战。除了大清帝国的“锋刃”索伦兵，乾隆还征发京师八旗兵、四川绿营兵、金川土司兵以及厄鲁特骑兵从征，这些都是大清帝国的“样板部队”，也反映了乾隆想毕其功于一役的决心。

乾隆五十七年（1792年）正月二十三日，福康安抵达拉萨，在布达拉宫会见达赖喇嘛、班禅等西藏地方头面人物，福康安对他们传达了乾隆皇帝的指示，要求其必须全心全意协助清军讨伐廓尔喀。在拉萨，福康安一面整顿军备，对之前作战不利的将领进行处罚，并提拔了那些作战勇敢的军官，一时间西藏清军士气为之一振，迅速收复了聂拉木。同时，积蓄粮草，休养生息，等待后方大部队一到就对廓尔喀进行雷霆一击，二征廓尔喀军事行动正式打响。

闰四月十八日，福康安、海兰察、惠龄由日喀则出征，当月二十七日，抵达定日之第哩朗古，清军在此与廓尔喀军遭遇，双方展开惨烈的白刃战，清军首战大胜，廓尔喀军溃败，福康安指挥清军乘胜追击，至五月初十日，清兵收复定日、济咙、萨迦等地，廓尔喀人被全部驱逐出西藏，西藏失地全部光复。

乾隆已经不满足只是收复失地这么简单了，他要扬威异域，他要直捣敌巢穴。作为乾隆的心腹爱将福康安对乾隆的心思是最为明白，于是福康安马不停蹄继续朝着廓尔喀境内打去，带领清军翻越喜马拉雅山，先后历经热索桥之战、协布噜之战、东觉山之战、帕朗古之战等血战，最终兵临廓尔喀都城加德满都城下，迫使廓尔喀与大清帝国签订城下之盟，廓尔喀对大清帝国称臣纳贡，成为大清帝国最后一个藩属国，大清帝国的声威远被南亚次大陆。