《鹊刀门传奇》讲述了一个另类的武侠故事。某朝末年，倭乱四起，宦官专权，东厂曹公公（杨树林饰）勾结倭寇，意欲谋反。

鹊刀门掌门西门长海（赵本山饰）是抗倭联盟的中坚力量，为了剿灭倭寇，他打算前去调查勾结倭寇的朝中汉奸，却又担心掌门人突然离开门派会引来外界猜疑。为此，西门长海找到孪生兄弟、胆小怕事的厨子西门长在（赵本山饰）冒充自己执掌门派。就这样，厨子变掌门，一段啼笑皆非的“传奇”由此展开。

与《武林外传》相似，该剧是一部解构“江湖”的情景喜剧，故事核心场景基本发生在鹊刀门，取景空间不大，每集围绕一个主题展开，依靠接二连三的“包袱”逐渐铺开“江湖”面貌。剧中的不少“包袱”值得玩味，比如鹊刀门三位徒弟郝盟、赵德柱和姜玉郎报名参加了江湖选秀节目《大侠请就位》，购买了栏目主办权的金钱帮资方代表贾如造访鹊刀门，提出了一个合作条件，只要鹊刀门能给每个徒弟交五百两银子，她就能保证徒弟进入前三名，因为评委都是金钱帮提前安排好的自己人。这种对现实中选秀节目的讽刺让人忍俊不禁。

该剧还是一部古代叙事框架下充斥现代性元素的剧集，不乏无厘头梗。比如，西门长在为了躲避追杀，竟然躲进了一个大衣柜里，还在里面睡着了。当他被发现时，他还说自己是在“闭关修炼”。这种无厘头的情节让人捧腹大笑。

除了剧情，剧中的人物也非常有特点。赵本山饰演的西门长海和西门长在是一对性格迥异的孪生兄弟，一个勇敢无畏，一个胆小怕事，两人之间的互动非常有趣。程野饰演的大徒弟郝盟是一个贪吃的胖子，经常因为吃东西而闹出笑话。宋晓峰饰演的二徒弟赵德柱则是一个有点傻的人，总是被人欺负。宋小宝饰演的天池帮一把手则是一个狡猾的人，经常出一些馊主意。这些人物的性格特点都非常鲜明，让人印象深刻。