海关总署并不是国务院组成部门，而是国务院的直属机构，为正部级。

需要说明的是，不是沿海才有海关，海关是一个统称，它是负责国家进出口货物检查的机构，机场有海关、边贸有海关、邮局有海关；海关系统的组织结构可以分为“海关总署”——“直属海关”——“隶属海关”，实行垂直领导的体制；

一、海关总署

根据三定方案，海关总署设置办公厅(国家口岸办)、政策法规司、综合业务司、自贸区和特殊区域发展司、风险管理司、关税征管司、卫生检疫司、动植物检疫司、进出口食品安全局、商品检验司、口岸监管司、统计分析司、企业管理和稽查司、缉私局(全国打私办)、国际合作司(港澳台办公室)、财务司、科技发展司、督察内审司和人事教育司19个司局以及政治部、机关党委和离退休干部局；

总署设署长1名，副署长4名，政治部主任(副部长级)1名，总工程师和总检验师为司局级；

1、直属海关

所谓直属海关，指的是直接由海关总署领导的海关，均为正厅（局）级。

目前我国共有42个直属海关，分布在全国31个省（自治区、直辖市），原则上一个省区设置1个直属海关，另外计划单列市单设直属海关，其中这几个省区不只一个直属海关：

广东有7个正厅级直属海关，分别是：广州海关、深圳海关、汕头海关、黄埔海关、拱北海关、江门海关和湛江海关；

另外四个计划单列市所在省份：辽宁设有大连海关和沈阳海关、山东设有青岛海关和济南海关、浙江设有杭州海关和宁波海关、福建设有福州海关和厦门海关；

唯一特例内蒙古设有呼和浩特海关和满洲里海关；

其他省区均只有一个直属海关，依次是：北京海关、天津海关、石家庄海关、太原海关、长春海关、哈尔滨海关、上海海关、南京海关、合肥海关、南昌海关、郑州海关、武汉海关、长沙海关、南宁海关、海口海关、重庆海关、成都海关、贵阳海关、昆明海关、拉萨海关、西安海关、兰州海关、西宁海关、银川海关和乌鲁木齐海关；

直属海关内设机构一般也有：办公室、口岸监管处、稽查处、卫生检疫处、督察内审处、法规处、监察室、动植物检疫处、行邮监管处、缉私局、人事处、综合业务处、离退休干部办公室、进出口食品安全处、统计分析处、财务处、教育处、关税处、商品检验处、企业管理处、科技处和机关党委；

除缉私局一般明确为副厅级，其他都是正处级；

除了42个直属海关，总署另有三个直属海关单位，为：

2、广东分署。

广东分署是总署直接领导的正厅局级派出机构。内设有副厅级机构（缉私局）1个、其余正处级机构15个，代管副厅局级的全国海关信息中心广东分中心；

因为广东有七个正厅级直属海关，广东分署主要是协调广东省内海关，并承担一定的监督检查、审计巡视等工作；

于是广东分署就有“正厅管正厅”的情况；

3、两个特派办

总署驻上海特派员办事处和驻天津特派员办事处，主要是负责管辖范围内直属海关(院校)执法监督、干部监督、党风廉政监督等工作，均为正厅级；

所谓隶属海关，指的是由直属海关领导、负责办理具体海关业务的海关部门，绝大部分为正处级、少部分副厅级；

隶属海关根据需要设置，比如小编所在城市厦门，厦门海关的隶属海关有：

泉州海关（副厅级）、高崎海关、海沧海关、龙岩海关、厦门机场海关、集同海关、漳州海关、厦门邮轮港海关、翔安海关、东山海关、厦门邮局海关、东渡海关和古雷海关；

除个别重要、大的隶属海关会明确为副厅级建制外，其余隶属海关均为正处级；

正处级隶属海关根据监管范围、业务体量不等，内设（直属）科级单位差别较大；

稍微大点的隶属海关设有办公室、人事政工科、综合保障科、运行监控科、法律事务科、统计科、综合业务一科、综合业务二科、查验一科、查验二科、查验三科、查验四科、核查科、产品监管科、物流监管一科、物流监管二科、船舶监管科和保税监管科等十几个科室；

小一点的隶属海关设有办公室、法律事务科、综合业务科、查验科、口岸监督科几个科室