民国时期，军统是国民党的特务组织，其目的就是为了维护蒋介石的独裁统治，而执行一些见不得光的任务，军统的领导人戴笠，被称为“蒋介石的佩剑”，也是民国的“特务王”。
抗日战争结束后，戴笠在一场空难中去世，接着军统被改组成保密局，郑介民和毛人凤是负责人，保密局归“国防部”直接管辖。保密局成立后，还是按照着军统的那套模式，在国内的大型城市，都建立了情报站，然后派王牌特务担任站长。
吕世琨早年只是一个普通的化学专业学生，后来在机缘巧合下，加入到军统成为特务，之后一直就在四川发展。吕世琨办事能力强，因此被上司看重，得到了很好的培养，渐渐成长为军统的王牌特务。
解放战争时期，军统已经改组成保密局，吕世琨先后担任过重庆站和成都站的站长，任职期间他破坏了中共地下党，在重庆创办的“挺进报”，抓捕了不少人。解放战争结束后，吕世琨去往了台湾，在警界担任重要职务。
1915年，吕世琨出生于四川华阳，他的堂叔吕康是川军的一个高级将领，吕世琨从小接受了良好教育，按照这个条件算，他的出生家庭应该属于地主阶级。
1930年，吕世琨考入成都的省工业专科学校，在那里学习化学专业。
1933年，吕世琨毕业后回到老家，由于父亲已经去世，他留在家里帮母亲打理家产。
1935年11月，吕世琨在复兴社的成都组当通讯员，复兴社是国民党的第一个特务组织，就这样吕世琨开始了特务生涯。
1936年6月，复兴社特务处的成都站成立，何龙庆担任站长，吕世琨为上尉通讯员，特务处就是军统的前身。
1939年，抗日战争时期，吕世琨在军统里面表现优秀，因此被选为情报骨干分子，送往位于湖南黔阳的军统训练班特训。10月，吕世琨结束特训后，担任重庆卫戍司令部稽查处第二科的少校科员，稽查处处长赵世瑞也是军统的资深特务。
赵世瑞
1939年底，吕世琨升为稽查处第二科的编审股中校股长。
1940年1月，吕世琨调往中央警官学校，在特种警察训练班里面当中校助理教官，后来又升为正式教官。
1941年2月，吕世琨调往军统重庆特区，担任邮电检查所电话监听组中校组长，专门负责电话监听的任务。5月，吕世琨调任军统重庆特区情报股中校助理书记。
1942年12月，吕世琨正式成为国民党党员。
1944年4月，姜绍谟担任军统重庆特区的区长，吕世琨为人事股的中校股长。
1945年8月，抗日战争结束后，叶翔之成为重庆特区的区长，吕世琨升为情报科的上校科长。
毛人凤
1946年6月，戴笠在空难中去世，军统改组成保密局，郑介民和毛人凤为负责人，李修凯担任保密局重庆站的站长，吕世琨升为上校副站长。
1948年1月，解放战争时期，吕世琨升为保密局重庆站的少将站长。担任重庆站站长的时候，吕世琨下属的情报组组长李克昌，在文城出版社安插了一个眼线，发现了《挺进报》的发行据点，《挺进报》是中共地下党发行的报纸。
这个李克昌非常狡猾，号称是“红旗特务”，而且非常能吃苦，经常亲自到底层化妆侦查，吕世琨非常重用李克昌。李克昌平时会化妆混入工农群众的基层，在重庆的各大工厂中迷惑工人，从而发展军统基层的情报人员，再把得到的一些情报交给吕世琨，然后吕世琨再添油加醋，在重庆的《新华实报》刊登“反共”言论，用来迷惑群众，抹黑共产党。
除了在宣传上抹黑共产党外，吕世琨和李克昌还会安排一些特务，潜伏到重庆的民营工厂里面，监视着工人们有没有“亲共”行为。
有一天晚上，吕世琨和李克昌带着一个年轻人，去见保密局西南特区的负责人徐远举，吕世琨说发现了《挺进报》的发行地点，就在文城出版社里面。吕世琨说他把这个年轻特务，先前安插到文城出版社干杂活，认识到店员陈柏林，那个陈柏林是中共地下党，经过一段时间的接触，陈柏林想介绍年轻特务加入共产党，因此发现文城出版社有问题。
徐远举知道这个情况后，让吕世琨和李克昌不要打草惊蛇，先秘密监视文城出版社，避免一无所获的情况。过了几天后，吕世琨又找到徐远举，说自己安插的特务已经获得了陈柏生的信任，还要介绍他给上级认识，见面地点就在观音岩红球坝的某工厂。
徐远举
等到见面那天，吕世琨带着大批特务提前埋伏到见面地点，不一会陈柏生果然和上级领导出现，吕世琨就让特务们把二人逮捕。接着吕世琨又带人抓捕了《挺进报》的印刷工人，和一些相关人员，最终《挺进报》机关被破坏，陈柏林等人也遭到杀害。
1949年6月，解放战争末期，吕世琨调往成都，担任保密局成都站的少将站长。12月，在四川全部解放前，吕世琨逃到了台湾。
1950年3月，吕世琨担任“交通部”铁道运输处铁路警察局秘书，能得到这个职务，都是靠着毛人凤的关系。8月，吕世琨成为铁路警察局警务处的段长。
1952年1月，吕世琨担任铁路警察局第二路段的警务处长。
1957年1月，吕世琨担任桃园县警察局秘书。
台湾警察
1959年3月，吕世琨担任桃园县警察局督察长。
1961年3月，吕世琨升为台湾公路警察大队的大队长，兼公路段稽查组少将组长。
1963年10月，吕世琨担任澎湖警察局副局长。
1966年6月，吕世琨升为台南县警察局副局长。8月，他又调往台北，担任台北警察局副局长。
1967年9月，吕世琨担任台北警察局主任秘书。
1972年12月，吕世琨从警界退休。
1974年，吕世琨开始在商界发展，当过水晶玻璃公司的总经理兼技术总监。
1988年，吕世琨从商界退休。
1989年5月，吕世琨回到大陆探亲。
2002年，吕世琨因为年纪越来越大，所以断决了外界的一些活动。
2005年，吕世琨在台北去世，终年九十岁。
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