毕业论文中自己的内容通常不算重复。论文查重的目的主要是为了检测论文中是否存在抄袭或过度引用他人研究成果的情况。在查重过程中，系统主要会对比提交的论文与数据库中的内容，以确定是否存在重复或相似的内容。

对于自己的内容，即原创性的思考和表述，查重系统通常不会将其视为重复。这是因为查重系统主要关注的是文本匹配算法，通过比较字符数量、相似度百分比、匹配的长度和连续性等因素来判断是否存在重复。而原创性的内容，由于是作者自己的思考和表述，与数据库中的内容不会存在直接的匹配关系。

然而，需要注意的是，如果作者在论文中使用了自己之前发表过的文章或研究成果，并且这部分内容被查重系统所收录，那么这部分内容可能会被视为重复。为了避免这种情况，作者在撰写毕业论文时，应该尽量避免直接引用自己之前发表过的文章或研究成果，或者对其进行适当的改写和重组，以降低查重率。

此外，还需要注意的是，查重系统并非完美，有时可能会出现误报或漏报的情况。因此，在使用查重系统时，作者仍需要进行人工审查和修改，以确保论文的原创性和质量。同时，也应该遵守学术诚信原则，避免抄袭或过度引用他人研究成果的行为。

综上所述，毕业论文中自己的内容通常不算重复，但需要注意避免直接引用自己之前发表过的文章或研究成果，并进行适当的人工审查和修改以确保论文的原创性和质量。